這正是韋皇后的高明之處。她通過改易制度獲得了百姓的擁戴，一步步為自己將來登上皇位鋪路。
上官婉兒也在極力輔佐韋皇后。她首先謀畫的，就是打壓張柬之等朝廷中的元老。她利用皇帝對自己的信任，向他舉薦了武三思，並與韋皇后合力誘使皇帝將武三思委以重任。
皇帝愈來愈依賴武三思，而冷落了張柬之等朝官。韋皇后趁張柬之等人不備，對其進行捧殺。她先讓皇帝封張柬之等5位朝廷元老為王，然後架空他們的權力，最後設計殺害他們。於是，韋皇后與上官婉兒掃除了朝廷中最大的阻礙，從此更加肆無忌憚。
上官婉兒為韋皇后做的第二件事，就是廢除太子李重俊。李重俊並非韋皇后親生，韋皇后對其早有忌憚。上官婉兒一直在尋找機會削減太子的勢力。武三思在成為皇帝親信後，來往宮中頗為頻繁，一來二往間，他與上官婉兒暗通款曲，關係更加親密起來。
於是，上官婉兒不斷扶植武氏一族，一方面維繫自己與武氏一脈的關係，另一方面可以藉此抑制皇族宗室的勢力。太子李重俊將他們這些齷齪勾當看在眼裡，一忍再忍，但韋皇后與上官婉兒一再逼迫，讓他不得不在隱忍中爆發。
西元707年，太子率領左羽林大將軍等300人，誅殺了武三思、武崇訓等武氏一族十餘人。上官婉兒聽聞大驚，趕緊逃到唐中宗與韋皇后跟前。她對皇帝說，太子這是造反，他要先殺了武氏一族，然後逼迫皇帝讓位。
唐中宗沒有對眼前慌張失措的上官婉兒產生絲毫懷疑，他勃然大怒，立刻帶著上官婉兒和安樂公主等人登上玄武門，下令讓大將劉景仁帶上2000餘人圍剿李重俊。李重俊寡不敵眾，含冤戰死。至此，上官婉兒為韋皇后掃除了第二個心腹大患。
在為韋皇后掃除兩大障礙之後，上官婉兒開始施展自己另一方面的抱負—文學。早在掖庭為奴之時，她就展現了詩詞方面的天賦；而在宮裡多年的薰陶與磨練更是讓她功力大增。
她曾寫下「書中無別意，惟悵久離居」的抒懷佳作，也曾藉「借問桃將李，相亂欲何如」展現自己的恢宏氣度。後世對她的文筆有著很高的評價，張鷟稱其為：「博涉經史，精研文筆，班婕妤、左嬪無以加。」呂溫更讚其：「漢家婕妤唐昭容，工詩能賦千載同。自言才藝是天真，不服丈夫勝婦人。」
上官婉兒不僅自己寫詩，更力圖讓文學之風盛行於天下。她不但勸說皇帝大量設置昭文館學士，廣召當朝詞學之臣，還主持了許多文學上的盛大活動，品評天下詩文。一時間，作詩成了大臣們的風尚。
《景龍文館記》中就記載道：「至幽求英俊，郁興辭藻，國有好文之士，朝無不學之臣，二十年間，野無遺逸，此其力也。」上官婉兒在文學上的個人造詣尚且不論，她在擴大書館、增設學士方面做出的努力，就足以讓她在眾星雲集的唐朝文壇占據一席之地了。
