在1997年1月20日的夜裡，申昌源從通風口逃了出去，接著迅速跑向監獄的圍牆邊，翻過重重高牆後，終於到了外面的世界，暫時結束了他長達8年的監獄生活。一逃出來後他馬上在附近一戶農家偷了衣服和自行車，騎到釜山市區再轉計程車逃往漢城（首爾）。
事發後1個多小時卻完全沒被警察發現，之後這越獄事件在韓國引起了不小的轟動，民眾大力抨擊監獄管理工作十分鬆懈。
這是申昌源第二次前往漢城，雖然在獄中學會一些木工的技術，不過礙於他還在逃亡、不能暴露行蹤，因此他只好「重操舊業」，在短時間內，他偷遍了韓國各地富豪，一共盜竊了9億8000多萬韓元。
此外，在逃獄後短短十幾天內，申昌源就交到了1位女朋友，之後2年的逃獄生涯，以難以置信的速度換了5位女友。他交的這些女朋友大多都是漢城的餐廳、咖啡廳的服務生，家境普通，幾乎每位女友都知道他的真實身分，為何她們沒有報警呢？
但因為申昌源每次約會都會為她們花下一筆錢，買名牌衣服和包包，所以這些女孩子都覺得他對她們很好，曾經他還為了追第一任女友，花了偷來的200萬韓元，用錢擄獲芳心，這也是為什麼他的女朋友們選擇不向警方報案的原因。
此外，申昌源也常捐錢給教堂、孤兒院和養老院，就這樣成了「韓版廖添丁」、現代洪吉童（朝鮮王朝燕山君在位期間的一個盜賊，以劫富濟童聞名韓國歷史），他還會去孤兒院跟小孩子玩，或是去養老院探望老人。
「如果當時有人能夠摸摸我的頭，說我是好孩子就好了…」
在申昌源逃獄之後，韓國警方為了盡快抓到嫌犯，投入大約90多萬警力，後來甚至還加入軍隊、多次提高懸賞金（上圖），但仍舊沒有申昌源的下落…
1999年7月16日，是再平凡不過的一天，申昌源躲藏在全羅南道順川市的一間公寓內，當天天然管線壞掉，於是他打給天然氣管道維修工，請他趕過來將這裡。這名維修工來到他的公寓時，發現公寓的男主人很眼熟，似乎就是新聞裡的那位通緝犯申昌源，於是他就偷偷報警。
接獲線報的警方立即衝向犯人住處，二話不說就將申昌源逮捕上銬，當時他穿著顯眼的花襯衫，被數十名警力團團包圍，但他的神情相當淡定、沒有一絲狼狽，這畫面傳遍了整個韓國之後，他身上這件花襯衫還被賣到斷貨。
申昌源被重新逮捕之後，被判了22年6個月的有期徒刑，至今仍在監獄裡服刑，現在的申昌源已經51歲了。不過，現在仍然有些韓國人認為這個判決，根本就是司法體系對申昌源的挾怨報復、有點過重了，應該給他減刑，但韓國的法院並沒有因為申昌源救過老人和孤兒，就法外開恩。
