準總統蔡英文與團隊核心成員們2、3月間緊鑼密鼓會商，由競選辦公室政策召集人林全出任閣揆，與競選團隊執行總幹事林錫耀搭檔組閣，副總統陳建仁、前國安會秘書長邱義仁與小英核心幕僚陳俊麟、劉建忻均分工協助籌組新的政府團隊，新內閣人事預計3月底、4月初底定，以確保新舊政府業務可以順利交接，知情人士指出，蔡英文與團隊成員多次開會，清晰傳達520上任的執政團隊組成將落實「地方中央經驗傳承，專業分工團隊戰力」的精神。
雙林內閣已然成形，實際上，蔡英文與團隊核心幕僚在確定府院黨高層人事後，隨即依各自專業分工、分頭思考、尋覓合適內閣成員，副總統陳建仁依其長期在公衛、生技領域專業，新內閣中有關衛福、醫療相關人事，主要由陳建仁負責規劃；準閣揆林全主要負責財經產業部分；內定的行政院副院長林錫耀參與內政、工程、交通等其他公務領域的規劃；內定的國安會副秘書長陳俊麟和前國安會秘書長邱義仁主要負責國安、國防部分；至於府內相關人事則由內定的總統府副秘書長劉建忻主責。除大致分工外，各方提出適合人選於蔡陣營核心小組會議中討論達成共識後，再展開徵詢當事人工作。
宜蘭縣副縣長吳澤成 可望執掌內政部
新執政團隊依「地方中央經驗傳承，專業分工團隊戰力」的精神來籌組。基於地方、中央執政經驗的延續，蔡英文在小組會議中多次提到，民進黨卸任縣市首長要參與中央新執政團隊的組成，現任宜蘭縣副縣長吳澤成可望出任外界視為「天下第一部」的內政部長。吳澤成是中央大學土木工程研究所碩士，擁有豐富的行政經歷，曾任基隆市、台北縣工務局長，北縣主秘和副縣長，扁政府時代，曾在蘇內閣擔任政務委員兼公共工程委員會主委，不僅嫻熟工程業務，特重公共工程品質及防災業務，曾參與大台北地區防洪工程的建置，並在台北縣建立工程防災體系，尤其在高雄氣爆、南台強震後，蔡英文格外重視老舊建物的安全和工程防災工作，正是吳澤成專長所在。
卸任屏東縣長曹啟鴻 內定出任農委會主委
另卸任屏東縣長曹啟鴻內定出任農委會主委，主要考量是曹啟鴻執政農業縣政績斐然，尤其在屏東落實「綠能造縣」理念，推動養水種電計畫，成功將綠能和農業結合，為屏東農民找到新的農業發展出路，蔡英文為達成2025非核家園目標將帶領執政團隊推動綠能，又考量台灣繼加入WTO到未來加入TPP等開放市場，勢必對台灣農業造成衝擊，台灣農業需要轉型並尋求新的契機才能永續發展，對發展農業具有多元創意思維的曹啟鴻正是蔡英文的最佳選擇。又具有財經專業的前台南市長許添財亦是蔡陣營思考網羅的對象。
將借重前執政團隊成員鄭麗君、邱太三經驗
在「經驗傳承」部分，蔡陣營在思考人事布局時，亦考量體現民進黨過去8年執政經驗的傳承，蔡英文的8年挑戰成功，毫無懸念順利當選2016年總統，她在民進黨過去8年執政期間，從陸委會主委、立委到行政院副院長的公職經驗，讓她對政府機制運作極為熟稔，又在馬政府執政8年中，多位扁政府時代的前任政務官持續參與民進黨智庫的政策評估、研擬討論，民進黨在野期間，形同影子內閣長期組成，才能順利再次執政，因此蔡英文於內部會議上亦強調，過去民進黨執政時期的成就必須一定程度體現與肯定，因此新的執政團隊中，勢必有民進黨前次執政團隊成員入列，包括新任閣揆、副閣揆，內定任文化部長的鄭麗君和可望出任法務部長的桃園市副市長邱太三等均是。
邱太三嫻熟中央、地方政務，又擅協調溝通，曾任高雄市、桃園市副市長，檢察官出身，在擔任陸委會副主委時與蔡英文合作默契極佳，一直被視為新內閣組成中的「活棋」，最後拍板確定邱太三擔任法務部長，正著眼於他與司法界多有淵源，且為司法界所肯定與接受，未來將可在推動司法改革工作上起事半功倍之效。
又基於專業分工與團隊戰力，從選舉團隊順利過渡到執政團隊，多位在大選期間擔任各政策小組召集人的成員都將進入新內閣出任政務委員，不同於國民黨政府的政務委員功能不顯，從扁政府到蔡英文的執政團隊，內閣中尤其重視各政務委員跨部會統籌推動政務的功能，因此競選團隊中擔任社會福利小組召集人的林萬億未來將持續在執政團隊推動社福和長照業務；另金融小組召集人施俊吉和競選辦公室政策執行長張景森均是未來協助新內閣跨部會落實蔡英文各項競選政策、政見的重要推手。
