直到上周，綠色和平與學界聯手，深澳燃煤電廠擴建案終於有了首份健康風險評估報告。據台電環差報告所示，變更後的深澳電廠開始運轉後，每年將產生1438公噸硫氧化物、1034公噸氮氧化物、以及268噸的粒狀污染物，污染濃度也比新設燃煤電廠的排放標準更低。
中興大學環境工程系教授莊秉潔利用台電的數據作為基礎，模擬各縣市的PM2.5增量。發現深澳電廠營運後，北部從宜蘭到新竹，除了台北市年平均增量0.16 ug/m3以外，其他縣市都增加0.2 ug/m3以上。越往南影響越小，以台東縣的0.004 ug/m3最輕微。
台大流行病學與預防醫學研究所副教授林先和，用缺血性心臟病、中風、肺癌與慢性阻塞性肺病當作指標，推估結果顯示，深澳電廠從2025年營運到2040年為止，15年間將導致全台576人因PM2.5罹患上述4種疾病而死亡，且其中145人無法活過70歲。
本島19縣市裡，新北市累積198人，因深澳電廠建成後、長期暴露在PM2.5之下而死亡，高居第一；其次是台北市90人，第三名的桃園市則佔79人，光這3個縣市的累積死亡人數總和便超過死亡總數的一半。
爭議三：海洋生態保育
10年前，台電曾言番仔澳灣沒有生態，如今當地資深潛水教練王銘祥，卻在深澳漁港附近、象鼻岩海域中發現10個籃球場大的珊瑚群。暱稱活塞教練的王銘祥，多次在抗議場合憤憤不平地強調，那些珊瑚都是天然的，直批「還沒有完全摸透就有這麼多珊瑚群，台電委託的生態調查究竟在做什麼？」
深澳燃煤電廠的海域設施，包含在瑞芳水產動植物繁殖保育區內，興建長度超過500公尺的防波堤，而整個深澳灣和部分瑞芳保育區，都涵蓋在深澳電廠港區範圍內。5月9日環評大會通過經濟部的報告，使深澳電廠環評正式生效，同時要求台電在興建防坡堤前，須針對海洋生態做「環境影響評估報告」。
不過，對於這樣亡羊補牢似的決議，隔日新北市農業局直接發布新聞稿，表明「不能認同通過環差再來補做調查報告的做法」，指台電在審查過程屢屢避重就輕，從未詳盡調查設置防坡堤會對漁業資源、深澳灣的生態、港灣內的漂砂和淤積產生什麼影響。
爭議四：深澳燃煤電廠的必要性
能源局副局長李君禮，在5月9日的環評大會上，說明政府預估台灣在2026年的尖峰負載約為4093萬瓩，倘若深澳電廠未能如期完工，2025、2026年的備用容量率將分別降為14.9%、13%；加之台灣有高達98%的能源仰賴進口，為了兼顧能源多元、分散供應風險和穩定供電，深澳電廠確實有興建的必要。
當時數名環評委員都對能源局的說法不買單，質疑從能源局的資料來看，仍舊看不出興建深澳電廠在能源政策上的必要性，但最終經閉門會議討論後，大會還是予以通過。
對此，綠色和平能源主任張凱婷形容，在能源轉型的關鍵時刻，政府若執意興建一座高污染、非必要的燃煤電廠，就是在能源轉型的路上開倒車。
