第三案：「你是否同意政府維持禁止開放日本福島311核災相關地區，包括福島與周遭4縣市（茨城、櫪木、群馬、千葉）等地區農產品及食品進口？」
爭議事項：
依公投法第30條：公民投票案經通過者，各該選舉委員會應於投票完畢7日內公告公民投票結果，其中第三項：「有關重大政策者，應由總統或權責機關為實現該公民投票案內容之必要處置。」
一、多數公投過關，也無法改變客觀事實：像逐年降低火力發電廠發電量的「反空汙」公投，就算過關，但再生能源無法有效取代核電，減少火力發電，台灣缺電危機還是無解。
二、若國民黨重大政策「反空汙、反深澳電廠、反核食」等3公投案就算過關，權責機關仍必須考量電力供給、外交等問題，因此是否依照公投結果執行，將會是權責單位的難題。
紀政重大政策1案：2020東奧正名公投
由前奧運國手紀政所提的「以『台灣』為全名申請參加國際運動賽事及2020年東京奧運」，東奧正名公投即使過關，因國際奧會已表明不接受改名，權責單位恐很難執行。
紀政東京奧運台灣正名公投：
主文：「你是否同意，以「台灣」（Taiwan）為全名申請參加所有國際運動賽事及2020年東京奧運？」。
紀政所提的以台灣申請參加國際運動賽事及2020年東京奧運，自中選會通過並於4月3日領取連署人名冊格式，即開始宣傳；然而截至7月，連署進度僅7萬餘人，距離28萬1745人的門檻距離很大。由於中國施壓反成案，在9月3日向中選會遞交52萬6688份公投連署書，爭取將參賽名稱「中華台北」正名為台灣。
爭議事項：
一、公投固然有拘束力，但沒有強制執行力
如前所述重大政策公投結果，應由總統或權責機關為實現該公民投票案內容之必要處置。但東奧正名的公投結果，還是得經過國際奧委會的同意，並非台灣方面就可決定。以台中市已爭取主辦的東亞青年運動會，因為遭中國以台灣民間發起「東京奧運正名」公投，在會議中取消台中市主辦權；目前國際奧委會已表明不接受中華台北奧會改名，所以即使年底通過，權責單位也很難執行。
二、質疑賴清德對「加入聯合國、東奧正名公投做了多少？」
前總統陳水扁：什麼都不做叫「務實台獨」？他所謂「務實台獨」，指的就是民進黨《台灣前途決議文》。日前陳水扁接受日媒專訪認為，面對中國威脅，台灣無法以傳統武力對抗，應以民主的方法作為因應之道，像是舉行「不要被中國併吞」、或者「以台灣之名參加東京奧運」的公民投票，藉此展現具體民意，努力獲得國際社會的理解。但蔡政府所謂維持現狀，是希望永遠維持台灣現狀。現在民進黨連「反對一中」都不敢說，這是賴揆所謂的「務實台獨」嗎？
