台北市長柯文哲日前在議會備詢時，被民進黨議員簡舒培問及北農總經理吳音寧被攻擊，是否是因為市場改建相關問題，因吳提出省下11億的市場改建方案，柯還為此動怒，批評吳音寧「懂什麼」，吳也透過新聞稿反擊。柯文哲1日表示，若北農連董事長、董事會都說不知道，這到底是公司的意見還是總經理個人的意見？柯還說，市場改建涉及周邊社區與數個公會，市府考量與單一公司考量會不同。
北市議員簡舒培30日質詢時表示，吳音寧對第一果菜市場，提出一個可以省11億的改建版本，但未被市府接受，她合理質疑吳是否因此遭到打壓，柯文哲反問簡是否是在指控他們貪汙？柯文哲當時說，北市府內很多專業人士，該市場改建已研究多年，還嗆說沒有理由輸給一個北農的總經理，吳音寧「懂什麼東西啊？ 」
北農31日發出新聞稿，表示吳音寧上任後便立即啟動第一果菜批發市場改建執行小組，並親自擔任召集人，小組成員包括各相關部會業務、管理、企劃、資訊暨批發市場各組經驗豐富現場作業人員共同組成，積極研擬改建方案各相關需求。北農同時為周延規劃需求，去年9月敦聘具有批發市場規劃經驗的台大城鄉研究發展基金會作為改建工程規劃專業諮詢顧問，且有關改建進度、辦理情形及期程等均按時於董事會提報工作報告。
柯文哲1日受訪時，再度被問到吳音寧提出的市場改建方案一事。柯文哲說，就市政府角度來講，不是只有第一果菜市場，還牽涉到魚市場，而且還有好幾個公會，所以整個市政府的考量觀點會比單一一家公司的考量會不一樣。此外，如果在北農裡，董事長說不知道、董事會也說不知道，那這到底是北農公司的意見，還是總經理個人的意見？
