飛機曾在10秒間重新爬升1175英尺（358公尺），但馬上再度急降，於06:22:35 GMT在3225英尺（982公尺）高度最後一次發出信號。
澳大利亞新南威爾士大學工程學院航空專家索尼婭·布朗博士（Dr Sonya Brown）曾對BBC評論說：「這是極端的過分，一般航班我們都不會看到這樣的事情。飛機幾乎是垂直的。」
墜毀客機上的兩個「黑匣子」（黑盒）飛行記錄儀——駕駛艙話音記錄器（CVR）和飛行數據記錄器（FDR）——先後在3月23日和27日尋獲，並送往美國NTSB位於華盛頓的實驗室。NTSB先後於4月1日和6日宣佈正在協助中方下載黑匣子內數據。
空難發生後約一個月，中國民航局於去年4月20日公布了初步調查結果，但只有預期之內的一些基本信息。
2023年3月20日晚間，中國民航局發佈《關於「3·21」東航MU5735航空器飛行事故調查進展情況的通報》，證實調查報告尚待完成。
通報寫道：「一年來，技術調查組對飛機殘骸進行詳細檢查，確定墜地前飛機關鍵操縱部件可能的工作狀態，對100餘件重要殘骸進行實驗，分析損壞原因；對機組成員的資質能力、航班運行、飛機適航維修、航空公司組織管理等情況開展調查；對空中交通管制服務，機場地面保障，旅客、行李、貨郵的安檢和裝載，危險品載運等情況開展調查；結合相關數據對飛機最後階段飛行狀態進行分析，使用飛行模擬機和真機開展模擬驗證。」
「截至目前，技術調查組開展了現場勘查、資料檢查、人員訪談、實驗分析等大量工作，但由於本起事故非常複雜、極為罕見，調查還在持續深入進行中。」
官方新華社同時發佈「民航專家解讀」文章，強調沒能在一年之內完成調查並無不妥。
新華社文章引述南京航空航天大學民航學院副院長邵荃說：「一般來說，大型運輸航空事故調查的週期往往都超過一年……統計表明，過去30年全球民航所發生的千餘起商業航空事故中，在一年內發佈最終報告的僅佔25%。」
MU5735空難報告尚未發表，有哪些問題仍待解答？
自事發以來，有關MU5735空難的最大爭議，在於這到底是意外還是人為，是機件問題還是有人蓄意為之。
東方航空雲南有限公司董事長孫世英去年3月23日曾說：「飛機失事時，航路上天氣適航，無危險天氣。」
孫世英還說：「這架飛機是2015年6月22日引進，飛機維修一直嚴格按照維修技術方案實施，技術狀況穩定正常。起飛前，飛機符合維修放行標凖和適航要求，正常放行。」
