喧騰七個半月未決，前中研院長李遠哲「終於」比較完整地提出他的看法，此前他曾經數次婉轉撇清他和台大校長遴選的「關係」，既否認他介入或運用影響力，也否認他與校長被推荐人周美吟有師生關係，還說出「難道我是黑道大哥嗎？」這樣奇怪的話。
這一次，他直截了當說台大選不出好校長，還說「管中閔被拉上來，背後有很不好的事」，這句話，他之前也說過，只是台大和他對「背後有什麼不好的事」顯然認知不同，當然，他更認為台大校長自遴選完成迄今懸缺，非關政治干預，也非關學術自由。
連贓都沒栽的指控，就是「莫須有」
李遠哲身為諾貝爾化學獎得主、前中研院長，望重士林，特別受民進黨政府─不論是扁政府或蔡政府─重視，他對台大校長爭議的意見，固屬「個人之見」的言論自由，卻不能不重視，儘管他有沒有講話，大概都改變不了民進黨蔡政府解決不了台大校長人事案的事實，他不講話，也看不出教育部敢發聘；他一開口，新來乍到的教育部長葉俊榮肯定更沒輒，而且，基本堵住了葉俊榮「有溫度的（溝通）程序」。
有過監察委員懸缺四年、教育部長懸缺逾月，沒有台大校長，除了可能影響他們尚難估算的選票流失程度，民進黨蔡政府大概不會在意，然而，論事有是非，該說清楚的話，還是要說清楚，即使說話的人是諾貝爾獎得主，也得直面迎之，特別是他若對所謂「民主程序」、「大學自治」認知有如此巨大的落差，若他對大學校長遴選有意見，教育部就不發聘，那麼就別摘虛幌一招的假自治假民主，直接修改大學法，未來大學校長人選送諾貝爾獎得主辦公室核定得了。
李遠哲到底有沒有介入台大校長遴選運作，不必妄加揣測，就算有，不論運作成敗，是台大要擔起責任和後果。但他說管中閔當選背後「有不好的事」，到底不好的事是什麼事？是違法了？還是收受賄賂了？他不是含糊其詞，是根本沒詞！這叫連贓都沒栽的指控，用聽得懂的文言文說，這就是「莫須有」！
以清華選校長為傲，因為他是遴委會召集人
他用自己曾任清華大學校長遴選委員會召集人的經驗對比，說當年他們做了很多「自我教育」，了解清華的需要，選出國外很有名的教授當校長，指責台大（遴選委員會）做不到！「台大本身要檢討！」但當年清華遴選委員會做了什麼「自我教育」？是實地考察國外大學校長產生程序？閱讀各種國內外校長著作？還是聽到諾貝爾獎得主演講？他也沒說，率爾認定台大遴選委員會欠缺「自我教育」，台大遴選委員會還不知如何反駁，畢竟台大遴選委員會真沒有任何一位委員擁有諾貝爾獎這麼漂亮的資歷，但總不能因為台大沒找李遠哲擔任遴選委員會召集人，就認定台大遴委會欠教育吧？
何況，子非魚安知魚之樂，台大的需求和清華的需求未必相同，李遠哲說，清華選出國外很有名的教授，不知他對「國外很有名」的定義是什麼？台大選出的管中閔沒得到諾貝爾經濟學獎，但清華選出的校長也沒有啊，管中閔到底是不是「國際知名」學者？他除了是中研院士之外，也是世界科學院(The World Academy of Sciences, TWAS)院士，曾擔任多個經濟專業國際期刊的的副主編或客座主編，還是Symposium on Econometric Theory and Applications (SETA)國際會議的發起人，這個「國際學術資歷」即使不是這次台大遴選被推荐人之冠，也是數一數二。
至於管中閔當選，大家是不是很興奮？或許見仁見智，但總不能因為李遠哲一人失望，就擴而廣之推斷大家都不興奮吧？
李遠哲又說遴選過程有候選人被歸類為中研院派，做了不利連結，管中閔不正是中研院士嗎？還是在李遠哲心目中，管中閔這位他擔任院長時期獲選的中研院士，不是中研院的人？或者中研院分了派別？那李遠哲屬意哪一位中研院的人？何不一次講清楚？
管中閔不是被「拉上來」，而是被「選出來」
李遠哲說，「管中閔被拉上來，前面幾個人被拉下去」，「前面被拉下去」的沒有「幾個」，只有一位─中研院士、前副院長王汎森，在校務會議代表投票這一關就沒過，另外二位第一關沒過的不是中研院士；通過第一道遴選的有五 位，管中閔不算被「拉上來」，因為他的票數並不高，另外還有一位通過第一關票的中研院士是周美吟。到第二關遴選委員會投票是兩階段三次投票，還有教育部代表三席，若要說政治力，教育部代表才是「政治力」，管中閔第二階段兩次投票都過半數，管中閔不是「被拉上來」，他是被選出來，為什麼能當選？管中閔到現在大概都雲裡霧裡，就像他不明白到底是得罪了哪一路「天王」？讓他當選那一刻的榮耀竟成畢生最大羞辱！
台大校遴選程序擺在檯面上，被推荐人的治校理念說明完完整整網上公開，李遠哲不是遴委、不是校務會議代表，不在現場，但批評前總可以耐下心來好好看一 遍所有參選人的理念說明吧？誰的理念好、表現較出眾，躲都沒得躲，總不能李遠哲一人心有所屬，或心中獨有不屬（隨便誰當選都行，就是不能要管中閔），就認定台大都糊塗吧？
台大校長案延燒七個半月不能止血，到底癥結在哪裡？李遠哲不說，眾人不敢妄議，李遠哲既然開了金口，不能不提醒，李遠哲可以主導教改，因為教改小組召集人是總統指派的任務，但在台大校長人事案上，真的沒有李遠哲可以主導的空間，總不能李遠哲認定的教改才是教改，李遠哲認定的大學校長才是學術自由吧？管中閔到底能不能當好台大校長，沒人可以幫管背書，但教育部不發聘給校長當選人，就是政治干預！
李遠哲感嘆台大沒有進步，確實讓人感傷，大學自治三十年，台大依舊府、院、教育部公公婆婆成群，連民進黨都能將「拔管」做為「全黨政策」（與教育部長擦身而過的立委管碧玲語），現在還多了前中研院長都能成為大學校長遴選的擋路石，不只台大、台灣高教要進步，難矣。
