濟州四三事件本質上也是一起當地人民不堪美國軍管政府與其走狗的暴虐壓迫，秘密組織武力奮起抵抗的民變。民變武裝由於事前就與島上的韓國駐軍達成了互不侵犯的默契，在迅速拿下島上的各警察局，並解決也擁有一定武裝的右翼團體後，就基本上控制了全島，但是一如228事件的發展，這就種下稍後執政者從本土調兵前來鎮壓的陰影。
由於43事件的發起者帶有相當高度的左派思想，而重要的是濟州島又有控制對馬海峽地點險要的戰略價值。美軍政府強烈質疑民變武裝的背後，顯然有南朝鮮勞動黨（即北韓的執政黨朝鮮勞動黨在南韓的支部）的領導操縱，乃決定強力鎮壓。在迅速撤換了濟州島上與民變武裝關係良好的，駐軍第9聯隊指揮官金益烈以後，美韓聯軍從南韓出發登島，開始了血腥武力鎮壓濟州島的民變武裝。新任的第9聯隊長宋堯讚改採鐵血政策，對民變武裝盤據的地區進行了多次地反覆清剿，甚至如果有民變者不在家逃亡者，政府軍就殺害其家人的，野蠻到極點的「代殺」以為報復。
1948年8月，大韓民國成立後，李承晚政府為鎮壓民怨沸騰的島民與不斷擴大濟州島反政府運動，設置濟州島警備司令部，並於11月17日宣布濟州島戒嚴令，增派軍隊至當地開始大屠殺。鎮壓開始後，軍方發出布告稱，在距離海岸線五公里的山區地帶通行的人，都視為暴力份子予以格殺。從此美韓聯軍在傳說的「必要時留島不留人」的殘暴野蠻密令下，就對濟州島山區村落大肆展開“焦土化”的強力鎮壓作戰。後來美軍報告中記載了：「第九聯隊基於山區地帶村落的所有居民，明顯提供游擊隊幫助與方便的假設之下，而對村落居民進行有計劃的大屠殺。」
整個四三事件美韓聯軍對濟州島人民血腥殘忍的屠殺行動，一直持續到韓戰結束後，長達7年7個月，總共約犧牲了2萬5千~6萬個濟州居民，有姓名可考者1.4萬人。而當時濟州島全島人口只有30萬人，這成為韓國近代史上僅次於韓戰的巨大悲劇。
而濟州四三事件後來並不只限於濟州島而已，在很短的時間內就因為種種原因喪盡韓國人心的美軍政府，當時早已經坐在乾柴上，只等有人開第一槍。濟州四三事件的抗暴聲浪，很快就外溢到了韓國距離濟州島最近的陸地，自古以來就向有民變反政府頑強傳統的全羅道。在韓國歷史上極關鍵的1948年這一年，全羅道人民也沒有缺席。
1948年10月19日，駐守在全羅南道麗水郡的韓國國防警備隊（韓國陸軍前身）第14聯隊，接到前往濟州島鎮壓濟州島四三事件的命令，但他們卻不願把槍口對準自己的同胞。在光復初期就有計畫地滲透進入韓軍的南勞黨成員煽動下，14聯隊的左翼軍人也發動反美起義，響應濟州島四三事件。到21日起義軍已控制麗水、順天、寶城、光陽等地全境，全羅南道成為半島上第一張即將倒下的骨牌。
