國務院一方面對台灣情勢沒信心，一方面又要駐華人員介入國府內政問題，對國府逮捕台獨團體施壓干預，國府是為了政治安定與控制局勢，才會有逮捕與限制集會的處置，也難怪陳誠會在日記寫下美國分化政府與人民。美方人員一方面要台人成立組織，一方面又表現出與這個組織沒有關係的立場，這是個不負責任的態度，在其自以為是的政治理想下，不顧台灣局勢穩定的現實考慮，反而為台灣穩定製造很多不確定因素。
國府來台初期，美方幕後策動台人組織台灣民主協會，這個團體在國府壓力下消解了，但是台灣再解放聯盟卻是在境外成立，成員包括有台獨與左派成員，這個組織比台灣民主協會更敏感，國府擔心影響局勢，展開逮捕行動。在6月2日的機密電報，師樞安為了蔣經國逮捕多位台灣再解放聯盟成員，向國務院緊急請求指示，是否需要代表美國，向國府表達看法。師樞安批評國府讓人難以容忍的警察國家的方式，持續讓人民與政府距離越來越遠。國務院也立刻回電，指示師樞安以非正式方式向外交部討論這個逮捕問題。
7月14日機密電報，國務院命令師樞安找吳國楨，詢問被逮捕的台灣再解放聯盟成員的下落，國務院要求師樞安向吳國楨表達，國府已經在大陸與台灣失去民眾的支持，國府應該避免任何沒有必要的挑釁行動，促成台灣人的敵意。7月17日機密電報顯示，吳國楨不願意多談這個事情，吳國楨建議國務院最好不要找外交部，因為會造成高層的誤解。
師樞安解讀，吳國楨可能認為美國的利益已經太過頭，會造成他的麻煩，蔣中正對於美國干預介入是很敏感的。師樞安認為國府可能是為了要展示誰才是當家作主，才會採取嚴厲的措施。師樞安的解讀，與當時狀況相去不遠，蔣經國以嚴厲手段壓制台獨運動，也的確為國府統治帶來一段時間的穩定，爭取了台灣建設發展的機會，但後來的白色恐怖時期，也造就不少無辜受牽連者。
非常親美的吳國楨，當時都受不了美國過度干預國府內政，國府為了穩定台灣採取的嚴厲逮捕措施，美國卻認為會造成民眾與政府分裂，這個看法不能說是錯的，但美國對干預國府內政的頤指氣使，也難怪美國外交官在任何地方，都是毀譽參半。二十年後的1970年代，蔣經國在台灣開始大量重用台籍人士，不僅是安撫台人，某方面來說，也是在外交逐漸失去美國支持之下，藉重用台人，蔣經國向美國表態，國府已無力回到大陸，只能遷就台灣現實，為國府爭取更多時間。
1950年代的台灣民主協會與台灣再解放聯盟，都是以台人為主要成員的政治團體，也是台人與國府矛盾的具體化，台人與大陸人的關係，在二二八事件後，加上白色恐怖時期大量逮捕思想犯，造成雙方關係更不容易改善，經過幾十年的彼此融合互動，台人在台灣社會已經居主流地位，來自大陸的外省族群，反而失去台灣政治上的影響力，這當中美國幕後介入的影響，始終是存在的。台灣今日的統獨之爭，其實深層上與當年的省籍問題歧異有關，台人過去爭取主導，今日已經轉變，省籍界線模糊，而是所有在台灣居住的人，如何看待自己對台灣的認同，或者追求國家統一的理想。
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