根據司法部規定，穆勒只能對「通俄門」相關事件進行調查，倘若穆勒發現的新線索超出職權範圍，他必須尋求司法部副部長羅森斯坦（Rod Rosenstein）的意見，再由羅森斯坦決定是否交給穆勒偵辦，或是分配給其他聯邦檢察官調查；而檢察官必須提供確實證據，讓聯邦法官認為有犯罪行為，才會核准搜索令給FBI，此舉也讓抨擊穆勒的川普進退兩難。
川普曾批評「通俄門」全是子虛烏有，穆勒的調查形同「獵巫」，這次柯恩被FBI搜索，川普與穆勒之間的恩怨再度受到關注，川普9日也告訴媒體：「我們等著看會發生什麼事，很多人都說：『你必須開除他（穆勒）』。」不過這次搜索不是穆勒團隊執行，而是由另一批檢察官負責，而且是經由司法部高層許可，但若檢察官發現柯恩涉及「通俄門」案，則會把資訊提供給穆勒。
前紐約市長朱利安尼：穆勒可能想逼川普接受約談
另外，《華盛頓郵報》引述白宮人士說法稱，川普私下痛罵羅森斯坦，同時也指責司法部長賽辛斯（Jeff Sessions）與穆勒，想要知道是誰核准搜索行動。2017年3月，《華盛頓郵報》踢爆賽辛斯在總統大選期間，曾2度密會時任俄羅斯駐美大使季斯利亞克（Sergey Kislyak），卻在聯邦參議院任命聽證會上隱瞞此事，事情曝光後，賽辛斯宣布迴避所有關於「通俄門」的調查，由羅森斯坦負責。
川普好友、前紐約市長朱利安尼（Rudolph W. Giuliani）告訴《華盛頓郵報》，FBI搜索柯恩住處和辦公室「出手有點重」，「這很令人震驚？是的，但有很特別嗎？並沒有，這是檢察官取得資料的方式，可能得到鐵證而起訴嫌犯，或是證明無罪全身而退」；至於穆勒是否調查過頭，干涉川普「極度私人領域」，朱利安尼稱：「當下正在發生的事，或許是穆勒想施壓川普接受約談。」
對於柯莉佛封口費一事，川普上周首度開口談論，表示不知道柯恩從哪裡得到13萬美元，但對是否為柯恩設置基金不予回應，「你們必須去問柯恩，他是我的律師，你們（媒體）必須去問他」；白宮發言人桑德思（Sarah Huckabee Sanders）重申，川普否認與柯莉佛有一腿。柯莉佛稱，川普在2006年與她有過私密往來，當時川普的太太梅蘭妮亞（Melania Trump）才剛生下與川普的兒子巴倫（Barron Trump）3個月。
