世人嗜喝咖啡者眾。以美國人為例，每天要喝兩杯咖啡者約佔二九%；要喝三杯者佔一三%；四～五杯者佔一四%；每日喝六杯以上者也達九%。
當然飲用咖啡後許多人會覺得精力充沛，但也必須提醒咖啡因會損害一些維生素和礦物質的吸收，並加速其排泄。
下列五種是受影響比較重要的營養物質：
1 鈣：
每喝一杯咖啡約有五毫克的鈣由糞便或小便中排出，通常在喝咖啡數小時之後發生。咖啡也可能影響鈣的吸收以及促使鈣由骨骼中的釋出。但根據美國奧勒岡州Linus Pauling Institute的報告資料，事實上只要鈣的攝取正常，並沒有充分證據顯示咖啡會影響骨骼的健康。當然也有其他研究顯示，喝咖啡的量與骨質疏鬆的程度是有相關性的。顯然喝咖啡時考量因素包括是否正常攝取鈣、喝咖啡的量、和骨質本身健康程度。
2 維他命D：
維他命D與鈣質吸收關係密切，咖啡因（Caffeine）事實上也是維他命D接受體的抑制劑，因此可影響維他命D吸收，從而減少骨質密度，造成骨質疏鬆。基於此，Linus Pauling Institute建議限制咖啡量少於每日三杯，如同時有足夠的鈣與維他命D攝取，應可預防其潛在影響骨質的副作用。
3 鐵：
咖啡因會干擾鐵的吸收，因為咖啡所含的苯酚化合物（phenolic compounds）會與非血基質鐵（nonheme iron）結合。飲食中的鐵分為血基質鐵（heme iron）和非血基質鐵（nonheme iron）兩種，食物中的非血基質鐵主要是三價鐵，在小腸細胞的刷狀緣上的鐵離子還原酶還原為二價亞鐵離子，然後在十二指腸吸收。咖啡因對鐵吸收的干擾會影響紅血球生成，當攝食富含鐵的食物時，咖啡因可減少鐵的吸收達八○%。所以根據發表在《Food Science and Quality Management》的研究報告：「任何含咖啡因的飲料都應和含鐵的食物分開一小時以上，以免影響吸收。」
4 維他命B：
咖啡因有利尿作用，此即表示水溶性的維他命，包括維他命B，即可因增加尿量而流失，咖啡因甚至會干擾硫胺（Thiamine），又稱維生素B1的代謝。不過，咖啡因會增加胃酸分泌，經由增加胃壁細胞分泌的內生因子，反而增強維他命B12吸收。
5 鎂（Magnesium）：
根據發表在《Life Sciences》的小型研究，年齡在三十一～七十八歲女性若喝咖啡達6mg/kg咖啡因，則兩小時後尿中即會排出鎂、鈣、鈉、氯、鉀、肌酸酐、和水。且鈣、鎂在腎小管的重吸收亦下降。
