HPV人類乳突病毒有接近200種類型，部分類型會透過性行為感染人類生殖器及周邊皮膚，目前已證實會導致包括女性子宮頸癌、陰道癌、外陰癌，男性陰莖癌，兩性的肛門癌、頭頸癌及菜花等6癌1病，其中子宮頸癌高居女性主要癌症第8名，口腔口咽及下咽癌居第6名（不分男女）。
雖然HPV感染可以經由疫苗來預防，但由於大眾對於HPV的認識不足，尤其是對男性的致癌風險，疫苗接種率仍然很低。另外，國健署現階段從提供公費HPV疫苗施打的性別、疫苗價數到保護的型別，都無法滿足台灣臨床上與HPV相關的頭頸癌防治需要。
公費疫苗執行3年 性別、價數與保護型別應檢討
監察委員王幼鈴、田秋堇於2018年曾發出新聞稿，質疑「男性感染HPV病毒比例亦不低，免費疫苗接種排除男性的理由及依據為何？有無涉及差異待遇？」針對衛福部推動HPV疫苗免費接種政策提出疑慮並申請自動調查。
如今，國健署實施國一女生公費接種HPV疫苗政策已經3年，除了重新檢視上述HPV疫苗保護的價數、型別以及HPV衍伸致癌的醫學研究證據外，就國家整體性的公衛政策思考，男女健康權的平等，不分縣市民眾的健康權平等，並沒有被公平看待。
常見52、58型未涵蓋 現行疫苗防護力恐不足
世界衛生組織（WHO）2018年呼籲世界各國，應將子宮頸癌視為公共衛生目標「A world free of cervical cancer」；2020年又發表幫助全球消滅子宮頸癌的策略，預定2030年以前要消除HPV病毒的健康危害。衛福部國民健康署自2018年底起，為防治子宮頸癌，針對全國的國一（七年級）女生，實施全面接種HPV疫苗的政策；這也是回應WHO的一項重要政策。
然而，衛生福利部國健署現階段公費施打的HPV疫苗，主要能防護HPV16與18型2種病毒型，但根據中央研究院院士陳建仁教授（2011年）發表的研究顯示，另有第58和第52型在台灣盛行率高達44.6%。林口長庚醫院賴瓊慧教授（2007年）研究指出，HPV第16、18、52、58等型盛行率高達90.9%。
（延伸閱讀：後疫情時代誰是領頭羊？從「一國多制」的疫苗政策盤點各縣市健康競爭力）
依此台灣本土HPV的醫學研究看來，目前國健署全國施打的公費疫苗，並未能完全涵蓋這些台灣常見的型別，疫苗防護力有20%到30%的落差。台大醫院副院長、耳鼻喉部教授婁培人醫師認為，依靠目前的公費疫苗，想要達成WHO在2030年將子宮頸癌發生率降至「6/100000」以下的目標恐怕是做不到的。
肝病防治冠全球 HPV成下個公衛標的
東亞是世界上B型肝炎、C型肝炎最盛行的地方，台灣過去更被稱為是「肝病之島」，有8成的人曾感染過B型肝炎病毒，其中2成會走上「肝炎-肝硬化-肝癌」的不歸路而喪命。為解決這個健康威脅，台灣當年以超前部署的防治思維，在1986年開世界之先，為新生兒全面施打B型肝炎公費疫苗，獲得了巨大的成果，如今全世界有超過180國實施接種計畫。
2003年開始，在時任中研院教授的前副總統陳建仁推動下，台灣展開全面治療B肝與C肝的計畫。2016年因應WHO於2030年達到消除病毒性肝炎的目標，當時陳建仁統籌，衛福部成立「C型肝炎國家辦公室旗艦計畫」，利用精準篩檢、主動追蹤和跟進治療等方式；再結合健保的公費治療方案，將消除病毒性肝炎的目標設定在2025年，足足比WHO提早5年，成為總統蔡英文第一任重要的醫療公衛政策。這種超前的防疫思維，讓台灣的肝病防治成績領先全球，但在防治HPV病毒的威脅，卻沒有超前亦不見部署的公衛思維。
HPV感染率高達8成 6癌1病威脅不分男女
HPV病毒的威脅同樣廣大，人的一生感染HPV的機率高達80%，更可能會造成6癌1病，且經研究證實，不抽菸、不喝酒、不嚼食檳榔的口咽癌患者，與HPV感染呈現正相關。台大醫院副院長、耳鼻喉部教授婁培人醫師指出，近年醫界發現頭頸部癌與HPV感染相關外，以口咽扁平細胞癌最為顯著，已占美國口咽癌7成以上；台灣頭頸部癌患者中，HPV陽性的比率也高達3成，16年來成長約1倍，知名的影帝麥克．道格拉斯（Michael Douglas）就是因HPV感染引發的口咽癌。
婁培人醫師更指出，男性因為感染HPV以後，產生抗體的能力較差，致癌的風險比女性高很多，顯見男性施打HPV疫苗的必要性。但即使衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）已提出男（女）性施打建議，在目前衛福部的公衛政策上卻明顯被忽視。
歐盟曾建議各國不分性別，為民眾施打HPV疫苗，目前世界上已有超過40個國家實行男女共同施打，其中歐盟就有21國。面對HPV的威脅，澳洲堪稱是全世界最超前部署的國家，2007年開始提供女性HPV公費疫苗；2013年起，更領先全球，實施男女共同公費施打HPV疫苗的計畫，目標是將子宮頸癌發生率下降至6/100000，成為罕見疾病；並預計於2028年達到清除子宮頸癌目標，比WHO預訂的目標更早達成。如同台灣在防治肝炎的成就，超前部署讓澳洲在HPV的防治上領先全球，而台灣卻已經與世界脫軌。
疫苗升級防護力加倍 桃園、雲林女性最有福利
相比衛福部疫苗基金編列不足，無法不分性別的施打HPV疫苗，且公費疫苗防護力也僅涵蓋2型病毒，但還是有縣市政府排除困難，超前衛福部作法，讓當地女性享受全台最好的疫苗福利，而這同時也突顯出不同縣市民眾健康權並不平等的問題。
桃園市長鄭文燦一上任，就開六都之先，執行最前瞻的公衛政策，針對國二以上到高三的女生提供4價疫苗，是涵蓋年齡層最廣、執行時間最長的疫苗福利加碼方案；而他連續榮獲5星市長的成就，足證民眾對公衛政策的關心。另外，雲林縣財政狀況不及六都，卻積極爭取台塑集團王詹樣社福慈善基金的挹注，全面升級疫苗為9價疫苗，把台灣常見病毒型都涵蓋進去，防護力更全面，這也讓雲林縣的HPV疫苗政策曾被媒體點名讚揚。
