美國一直誤讀了支離破碎的阿富汗政治現實，除了地方軍閥根本不能打，阿富汗政府也一直沒辦法決定如何打擊神學士。因為包括地方政治的掮客與喀布爾中央，還有主要民族普什圖人（Pashtuns ）與少數民族──包括塔吉克人（Tajiks）、哈札拉人（Hazaras）和烏茲別克人（Uzbeks）──之間的關係緊張。
麥金利說，阿富汗的兩任總統卡札（Hamid Karzai）與賈尼都是通過政治分贓上位，他們並非懷抱一個促進共同國族的願景進行施政。阿富汗人口雖然超過3500萬，但2019年的阿富汗總統選舉僅有270萬人投票，選委會只計算了其中180萬張選票，這顯然不是阿富汗民主化的證據。美國對阿富汗政治與領導人的干預，結果只是破壞了阿富汗政府的獨立性和合法性，也讓神學士在阿富汗部分地區依舊得到支持、甚至得以繼續補充新血。
最後，美國雖然一直寄望巴基斯坦支持解決阿富汗戰爭，但美國政府顯然失敗了。巴基斯坦這些年一直是神學士的庇護所，伊斯蘭馬巴德的領導人顯然對阿富汗問題保持開放態度。即便賓拉登最後就是在巴基斯坦境內被發現以及擊斃，但美國與巴基斯坦依舊保持密切聯繫。想要打敗一個擁有跨境庇護所的叛亂分子極其困難，神學士在奎達與白沙瓦人籌集資金、策劃襲擊、招募新兵。阿富汗政府一再要求巴基斯坦協助關閉神學士基地，巴國卻置之不理，美國也沒能做出具體反制，最後招來了悲劇性的收場。
