《南海政策綱領》並設計由各部會執行下列工作：調查、登錄各島礁；保護漁業與航行；安全發展航運；建立衛星通訊設施與航行援助；興建機場及碼頭設施；改善醫療設備；設置環境資料庫；實行環保措施；收集可用資源之資訊；擬定發展計劃；研究有關南海政治及法律問題。
其中，南沙太平島建跑道、機場的提議一直未能付諸實踐。1995年6月，因為該年2月發生美濟礁區域緊張衝突情勢，經檢討「保七南巡事件」，決議強化南海小組功能，因此，行政院核定《南海突發事件緊急處理小組作業要點》。次年4月，台灣行政院進一步核定修正《南海問題討論會議結論分辦表》。
1990年代初期，李登輝總統曾提議，亞太國家共同參與亞洲集體安全體系；建議包括：成立集體安全基金、進行區域武力裁減及共同開發天然資源，以避免領土爭議所引發的軍事衝突。李登輝在提出共同開發南海天然資源建議後，於1994年11月主張「由各相關國家共同出資組成一個公司型態的組織」；1995年3月，又主張「邀請有關國家共同集資，籌設國際開發公司，暫時擱置主權爭議，共同開發當地資源，而所得盈餘提供各國作為基礎建設基金」。1995年8月，李登輝特別提議集資100億美金成立跨國南海開發公司，所得盈餘提供東協各國從事基礎建設之用。
李登輝在1999年提出「兩國論」之後，決定將駐守在南沙太平島的海軍陸戰隊換成海岸巡防部隊，之後再換成海岸巡防署。該項決定為軍事上的「信心建立措施」（Confidence-Building Measure, CBM），但其他東協國家並未採取類似的相對做法，也引起中國大陸猜疑台灣是否要放棄東、南沙。台灣內政部長余政憲於2003年8月16日訪問太平島時，順道登上距太平島2海里的中洲礁（Zhongzhou Reef，亦作Ban Than Reef），學者邱文彥建議以生態保育觀點，在該處建觀鳥亭。其後，海巡署在高雄備妥組裝式之木造小亭，於該處進行建議的搭建工程。中洲礁距離越南佔領之敦謙沙洲（Sand Cay）為7海里，2004年7月，越南政府抗議台灣在南沙群島的中洲礁上進行建築工程，表示「嚴重侵犯越南領土主權」。
*作者孫國祥為南華大學國際事務與企業學系副教授，專長亞太國際關係專題研究、區域主義研究、兩岸關係專題研究、國際政治經濟學專題研究、亞太非政府組織專題研究、亞太國際關係。本文選自作者《南海之爭的多元視角》（香港城市大學出版社）。
