美國大使館在11月14日給國務院的電報顯示，史慕特與美軍顧問團團長杜安拜會蔣中正，蔣中正原則同意外島裁軍，但是不能在遭受攻擊下撤出兵力，他也向美方提出外島增強火力的建議，美方提出增援金門12門240砲，12門155砲。馬祖4門240砲，一個營155砲，另外可考慮曲棍球地對地飛彈（後來外島並無美軍飛彈）。蔣中正提出增加外島戰車數量，美方同意研究。
王叔銘與杜安在1958年11月17日簽了有關外島撤軍的諒解備忘錄，但從11月過後，金門只撤出500人。根據1959年3月19日駐美大使葉公超與國務院官員的談話紀錄，王杜備忘錄提到金門只保留最多1萬5000人，美方會提供新式重型火砲，這個裁減外島兵力計畫在1959年6月30日完成，但因為金門沒有裁減兵力，這些火砲雖然已經運抵台灣，暫時由美方扣留不交給國府。由於時限快到了，國務院非常關切中國方面的進展。艾森豪總統也多次垂詢外島裁軍的進度，只能告訴他國府什麼也沒做。國務院希望葉公超能夠打破這個不幸的僵局。
葉公超告訴美方，蔣中正對於外島撤軍，必須透過人員遞補的過程掩飾，他六周前收到陸軍方面的消息，已經開始進行了。但是對於6月30日完成外島撤軍的事情，葉公超卻是很驚訝的表示，他完全不知情，他從來沒有聽到具體的時間。葉公超說，他會建議政府實施王杜協議，他建議美方不要再與王叔銘討論外島撤軍的事情，由美國大使與外交部長談，協防司令與國防部長談。
葉公超對美方提醒不要再跟王叔銘談外島撤軍，顯示葉公超已經感覺出問題了。1959年3月 21日，王叔銘通知杜安，1萬6645人在6月30日前撤出外島，杜安同意扣留的火砲運往金門。就在王杜協議完成外島撤軍的6月30日前一天，蔣中正將副總統陳誠、總統府祕書長張群、國防部長俞大維討論將領人事，陳誠當天的日記寫下，以王叔銘大亂，不宜再任參謀總長，俞大維說王一切很好，但做事太無重點。陳誠認為，蔣中正費九牛二虎之力培植王叔銘，結果如此，實堪注意。
陳誠的王叔銘大亂說法，顯示王叔銘真是闖了大禍。7月13日莊來德給國務院的電報，引述他與外交部長黃少谷7月11日的談話，黃少谷說，王叔銘下台，與中華民國對美國的態度有關，但對於雙方關係沒有特別的改變。王叔銘因為太傲慢，人際關係很差，行事不夠謹慎，才會下台。王叔銘決定很多事情都會跳過俞大維，而俞大維比較喜歡與彭孟緝合作（彭是王的前任，王垮台後，鵬又回任總長）。
從國務院資料看來，國府並不清楚王叔銘與美方共同協議外島撤軍，葉公超才會請美方找部長談，不要再與總掌談。黃少谷的行事不謹慎，可能也與此有關。蔣中正是願意在美國幫助下裁減兵力，但是不能接受雙方一起決定外島撤軍，尤其外島地位特殊，蔣中正更是態度保守，王杜協議後來其實等於是廢棄不算數了，因為金門駐防兵力並未減少太多，直到後來因為兩岸情勢改變，軍方精實案等兵力裁減方案，外島才真正撤軍，但那已是幾十年後了。
王叔銘與美方共同協議撤軍，立刻就被拔掉職務，派到國外去，不讓回到台灣，十年後，蔣經國也與美方碰到兵力調整的問題，自然更是小心，溫哈熊是蔣經國身邊的重要幕僚，他用王叔銘案說明蔣經國對中美共同商討裁軍的顧慮，顯示當時蔣經國的謹慎，避免再犯前人的錯誤，就在蔣經國與美方談過不久後，改任行政院副院長，仍然擁有對軍方掌控的實權，逐步往政壇高峰前進。
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