那麼台灣究竟是誰的？
理論上來看，承認中華人民共和國為中國的唯一合法政府，但又與維持高度自治的台灣維持實質關係最符合日本利益。所以提到台灣到底屬於誰的，日本的立場是強調自己在1951年的《對日和平條約》上放棄了台灣與澎湖，固無權決定誰能擁有台灣。獨派認為這是「台灣主權未定論」的論述來源，統派則以此攻擊日本對中國領土仍有野心。
然而由於美國承認在台灣的中華民國政府為中國唯一的合法政府，並希望以此號召全球反共華人團結在蔣中正的領導下，所以日本即便是想要不表態都不可得。為此高坂正堯在他1965年完成的《海洋國家日本的構想》中指出：「迄今為止，日本承認位於台灣的國民黨政府是中國的正統政府，日本的盟友美國強烈支持國民黨政府。」
美國不只強迫日本承認中華民國，還要求聯合國保留中華民國的一般會員國席位還有安全理事會常任理事國席位，這讓日本人面對台灣主權問題的時候沒有不表態的空間。1960年3月7日，時任日本首相的岸信介在參議院預算委員會中接受社會黨議員質詢時，明確表達了日本承認台灣與澎湖為中華民國領土的立場。
事實上，當天質詢岸信介的社會黨議員們質疑的也不是台灣到底屬不屬於「中國」，而是台灣屬於哪一個「中國」。岸信介以《中日和約》為標準，很明確表達日本承認的「中國」為中華民國：「日本已接受以開羅宣言為根據的波茨坦宣言，而日本在簽訂舊金山條約時已放棄對台灣的主權權利，日本和中華民國訂有條約，並承認那個政府是代表中國的。」
岸信介不只承認中華民國對台灣的主權，而且還將以陳智雄為代表的諸多激進台獨份子引渡回台灣，實在稱不上對獨派有多友好。雖然從2013年中國人民解放軍在西山無名英雄廣場上將陳智雄列為烈士這點來看，岸信介看似打擊台獨的行為更有可能是來自美國的授意，目的是將中共滲透到日本台灣人社團裡的間諜予以清除。
以「政經分離」模式對抗美國
可見戰後日本的外交政策，基本上是聽命於美國，沒有任何獨立性可言。美國要日本承認中華民國代表中國，日本就必須要承認中華民國代表中國，美國要日本承認台灣是中華民國的領土，日本就必須要承認台灣是中華民國的領土。甚至就連日本政府將有匪諜嫌疑的台獨人士引渡回台灣，似乎也與美國的幕後操作脫離不了關係。
缺乏外交自主性，是戰後日本被批評為「不正常國家」的一個最大原因，而外交自主性的缺乏，首先就反應在日本對華政策對美國的全面追隨上。日本也不是沒有試圖反抗過美國，然而膽敢反抗美國的日本首相下場往往只有一個，就是他們的政治生命極為短暫。比如鳩山一郎因為在1956年10月19日實現了與蘇聯的「國家正常化」，結果就在兩個月以後被迫內閣總辭。
