至於司法部長巴爾，如今也成為川普批評的對象，川普甚至不願意回答「巴爾是否會續任」的問題。《華郵》指出，除了巴爾親口表示，對於「通俄門」案對起源的調查，不會查到歐巴馬或拜登身上；川普也抱怨，巴爾雖然曾指派聯邦檢察官約翰‧杜然（John Durham）負責調查「通俄門」起源，但調查結果卻無法趕在大選投票前出爐。川普及其支持者一直認為，他所涉嫌的「通俄門」根本就是一場騙局跟圈套，當初的美國政府根本就是在對他進行違法的監聽與調查。
知情人士對《華郵》指出，川普非常關注杜然的調查結果，甚至只要電視播到相關新聞，川普就會馬上把電視音量調大。一名川普的顧問透露，總統曾對他說，原本以為巴爾會藉著杜然的調查結果發動「攻勢」，沒想到他們並沒有這麼做。部分政府官員擔心，川普一但連任，白宮可能會在選後「整頓人事」，除了摘掉瑞伊FBI局長的烏紗帽，連巴爾也連帶會成為犧牲品。
不過巴爾曾數度力保FBI局長，《華郵》也說，只要巴爾還留在司法部長的位置上，很難說川普是不是真的會對瑞伊下手。畢竟川普經常抱怨他的內閣成員，也不時表態說「考慮炒掉他們」，但他並不是每次都這麼做。2017年5月，當川普無預警解除柯密的FBI局長職位，當時就引發了軒然大波，外界猜測，柯密恐怕是不願配合川普放棄「通俄門」調查，才會慘遭拔官。此外，不少現任與退休官員都擔心，如果川普再度無視FBI局長的10年任期，恐怕會進一步削弱聯邦調查局的政治獨立性，也讓FBI再度受到傷害。
瑞伊「前科」累累，但深獲部署愛戴
2017年8月上任的瑞伊至今還做不到任期的三分之一，他是耶魯大學法學院出身，曾擔任過聯邦檢察官與小布希政府的司法助理部長。瑞伊當初曾在任命聽證會上表示，將「嚴格獨立照章辦事」。在走馬上任後，他也數度與川普意見相左，包括反對川普公布「證明司法部與FBI違法監聽」的「努尼斯備忘錄」。因為他認為該備忘錄「經過檢視，恐已刪除關鍵資訊，可能有失準確」，公布這種有問題的文件，對FBI同仁的士氣更將造成莫大打擊。
「努尼斯備忘錄」是什麼？
「努尼斯備忘錄」由共和黨籍的聯邦眾議院情報委員會主席努尼斯（Devin Nunes）主導調查，以「司法部與聯邦調查局對《外國情報通訊監察法》的濫用」（Foreign Intelligence Surveillance Act Abuses at the Department of Justice and the Federal Bureau of Investigation）為標題，指控司法部與FBI在2016年美國總統大選競選期間，向法院申請對川普幕僚佩吉（Carter Page）進行「電子監控」獲准，但這份備忘錄的情報來源大有問題，甚至刻意隱瞞部分資訊，FBI局長瑞伊也從頭到尾反對將其公開。
在川普批准公開「努尼斯備忘錄」後，瑞伊則馬上對3萬名FBI員工發出內部聲明，勉勵大家不要受到影響：「我對我們的任務全力以赴。我們都下定決心要依法獨立做好我們的工作，我會信守這一點。美國人民在報紙讀到那些事，他們在電視與社群媒體上聽到許多說法，但是他們也看到你們的經驗與實際的付出，你們讓美國社會安全，讓國家安全，而且經常在艱困的環境下處裡敏感資訊並做出決定。」
美國聯邦調查局探員協會（FBI Agents Association）主席布賴恩‧奧黑爾（Brian o’ hare）對《華郵》表示，過去三年，瑞伊面對的是「前所未有的挑戰」 ，他強調這位局長一直在努力維護 FBI 的公正和正直，並且推崇瑞伊總是關注真相、將工作重點聚焦在事實之上。
