國史館館長陳儀深說，李登輝在一九八八年繼任總統後，開始展現政治上的主見，一改「板凳坐三分之一」的溫良恭儉讓。這是李的獨到謀略，他在主流、非主流之爭，展現一出手就能擊中對方要害的高段劍道技巧。
台灣史專家、國史館館長陳儀深認為，李登輝將國民黨在台執政的路線本土化，奠定台灣永續經營的路線，確立台灣主體性，絕對是他對台灣很大的貢獻與影響。
李登輝自一九九○年起一連串的民主改革、修憲、國會全面改選，以達到「台灣化」，透過總統直選，奠定所謂的國家化。
小英「中華民國台灣」延續李路線
陳儀深說，李登輝主政時強調「中華民國在台灣」，而蔡英文任內提出「中華民國台灣」可說是延續李的路線。李在九九年提出特殊兩國論，是台灣主體性的美好句點，當時參與研議的國安會諮詢委員正是蔡英文。
國民黨非主流派說李登輝是台獨，但李稱自己從未主張過台獨，因為台灣已實質獨立。陳儀深認為，此一論述後來影響獨派大老主張及民進黨的《台灣前途決議文》，捨過去台獨公投的浪漫，在論述上與李的台灣主體路線產生趨同現象。
「李登輝的台灣心，在青年李登輝心中就有此傾向。」陳儀深說。李曾在留美時告訴其他台籍青年：「我們都是台灣人，想為台灣做什麼，大家都是同心，但情勢不對就不要冒險。」
陳儀深說，李在八八年繼任總統後，開始展現政治上的主見，一改「板凳坐三分之一」的溫良恭儉讓。這是李的獨到謀略，在主流、非主流之爭，展現一出手就能擊中對方要害的高段劍道技巧；改革過程也先以國是會議凝聚民意，再透過妥協，於黨內外突圍。
李登輝雖於九○年向黨外招手邀請參加國統會，隔年訂《國統綱領》，國家定位的問題看似很急，但陳儀深說「其實李登輝不急」，他只是在安北京的心，自己有設定的戰略目標，因此蔣緯國就曾批評這是「國家不統一綱領」。
至於遭批評的「戒急用忍」，陳儀深認為，李是擔心台灣對中國經貿依存度太高，經濟一體化會讓政治很難擺脫中國，這也是他謹慎務實的一面。
兩岸交往打破蔣經國「三不政策」
陳儀深表示，由於兩蔣都死在任內，因此國史館纂修國史時，並未對兩蔣進行口述訪談。直到前國史館館長張炎憲任內才首開對卸任總統訪談之例，對李登輝口述訪談約二、三十次，李的自我剖析也首度曝光。後續國史館館長吳密察也曾對前總統陳水扁進行口述訪談。
國史館依李登輝的口述訪談內容，留下《一個台灣人總統的誕生》影音及四冊訪談實錄（分成早年生活、政壇新星、信仰與哲學、財經產業）。
較具政治性的內容，是李登輝提供他與蔣經國相處四年的親手筆記，收錄在《見證台灣──蔣經國總統與我》一書。陳儀深說，此書所載顯示蔣晚年在公務上與李最為貼近，在無第二人知道蔣晚年政治上說了什麼、要做什麼，李提供解答──那就是要走向改革開放。
陳儀深說，李極力否認自己是台獨，但“Mr. Democracy”（民主先生）是沒有爭論的。李有一部分政治作為是承襲蔣經國路線，如解嚴、開放探親等，一部分則與蔣的不接觸、不談判、不妥協「三不政策」不同，例如李開啟了台灣與中國的接觸。
李登輝為何能在台籍菁英中脫穎而出？陳儀深認為一九七二年是關鍵，蔣經國當時為行政院長，任內邀李參政並擔任政委。
陳儀深花很長時間分析李受蔣器重、進而接班的歷史機緣。他指出，像李登輝這樣一位左派、有反抗思想的知青，也只有蔣經國敢用他，警總約談李的實錄可證。陳儀深說，從當時國際情勢觀察，蔣經國之所以選李，很有可能是企圖以提拔李等台籍菁英，來回應當時國際對台灣局勢的種種關切。
一九八○年代初，台灣發生不少國際關注的政治案件，如林宅血案、陳文成命案等，這都影響蔣經國挑李登輝為接班人，以回應國際壓力。蔣的選擇也促成八六年的反對黨組黨、八七年的解嚴等台灣重大民主進程。
任內靠民主化競爭維繫統治地位
陳儀深也說，李被揀選的另一項因素是，省主席任內以農經專業倡導八萬農業大軍，藉農村改革增加統治正當性。從李登輝的訪談口述歷史也可發現，蔣是刻意栽培李，包括剛當台北市長時，蔣一周多次到李登輝家，與李交換治理意見。
陳儀深總結說，台灣能有今日要感謝李登輝的堅持，為了台灣的主體性不屈服於強權體制。李十二年總統任內，並非靠威權統治或不公平競爭維持多數，而是靠民主化競爭，直至九九年之前，李登輝仍讓國民黨維持統治地位，這都是以正道的方式為之。
