維斯帕先後來登基成為羅馬皇帝，約瑟夫獲頒諸多榮譽和一筆退休養老金。約瑟夫冠上皇室名號「夫拉維」，以「夫拉維．約瑟夫」這個名字行走於羅馬境內。他在羅馬度過餘生，寫了兩部巨作：《猶太戰史》（The Jewish War）描寫了自西元六十六年至七十年間，猶太人所經歷的悲慘革命，以及引爆這場革命的導火線。《猶太古史》（The Antiquities of the Jews）則以聖經為本，書寫猶太人從創世以降，直到他所生活的那個時代的悠久歷史。
約瑟夫在他的著作中不只一次（其實是三次）冗長地詳述了愛色尼人，還附帶了許多參考資料。他把愛色尼、法利賽、撒督該並列為猶太三大教派，或說是三大「哲學學派」，就像是畢達哥拉斯（Pythagoreans）、斯多噶（Stoics）和伊比鳩魯（Epicureans）這些古典哲學學派一樣。
撒督該人中有大祭司和財大勢大的貴族，他們掌控了聖殿和首都耶路撒冷。他們的信仰聚焦在今生的祝福，只接受《摩西五經》（梅瑟五書）為聖經，凡是沒有明確記載於五經中的教義一律不接受，例如來生、天使和聖靈（聖神）。法利賽人則是一支偏重學術考究的教派，他們強調研讀聖經，期望所有猶太人都能遵行高標準的潔淨禮儀。他們使用的聖書類似於現今的猶太聖經，或是新教所採用的《舊約聖經》，內容比《摩西五經》收錄了更多經卷。儘管約瑟夫最終認同自己是法利賽人，但他似乎對愛色尼人更感興趣，在他的著作中，對這支教派的描述遠多於另外兩個教派。
「愛色尼」（Essene）一詞也許衍生自這個希伯來字「ôssîm」（實踐者），意思是「遵行律法的人」，儘管有其他人提出不同的詞源解釋。比起撒督該人或法利賽人，愛色尼人願意接納更多出於天啟的聖經書卷，包含了現今被猶太人和大多數基督徒視為偽經的經書，例如《禧年書》（The Book of Jubilee），以及杜撰的偽經合集《以諾一書》（1 Enoch）。他們和法利賽人一樣也接受天使與魔鬼、天堂與地獄、審判與復活，以及權威與傳統等教義。
但約瑟夫還提到了這個教派其他與眾不同的特點：他們過著清貧的生活、堅持物品公用、拒絕私人財產和放縱肉體的歡愉等等。大多數人放棄家庭生活，選擇生活在一個禁慾的男性團體當中，共用一張桌子，過著公有制的集體生活。他們全心致力於研讀聖經，特別是發預言，他們當中出現了許多因為預言神準而聞名的先知。他們穿著簡樸的白衣，每天都要進行聖浴潔淨身體，然後由一位祭司主領祝謝要吃喝的餅和酒。
