非洲醫療匱乏、不易取得水資源，專家擔憂非洲會成為新冠肺炎（武漢肺炎）疫情重災區，不過官方數據來看，新冠病毒在非洲的傳播速度卻較為緩慢。《經濟學人》16日分析指出，非洲確診病例僅占全球2%，可能是因為篩檢次數不多、且多國政府及早實施封鎖，才遏止疫情大爆發。不過基於部分國家意圖鬆綁封鎖措施，也有部分政府蓋牌、企圖掩飾疫情，學者推估非洲疫情可能不會出現指數式大爆發，但流行期會拉長。
西非國家迦納總統阿庫佛艾杜（Nana Akufo-Addo）於4月10日的全國談話指出，該國港口城市特馬（Tema）出現「超級傳播者」，在一間魚肉加工廠將病毒傳染給533人，占全國5408確診病例的10%。《經濟學人》（The Economist）認為，迦納能夠鎖定超級傳染者，要歸功於該國防疫措施。根據非洲疾病管制預防中心（ACDC），迦納是非洲人均篩檢率第四高的國家，目前已有超過15.5萬人接受篩檢。
非洲確診病例僅占全球2%，為什麼？
非洲總人口占全球17%，但確診病例占不到全球的2%，截至5月13日為止，非洲疾病管制預防中心統計共有6萬9947確診病例，其中2410病例死亡。而過去一個月中，非洲的病例新增速度約每兩週翻倍，美國近期則是每三天翻倍。
這可能反映非洲篩檢數不足，事實上，疫情爆發以來，全非洲僅檢驗了100萬人次，光是南非和迦納就占了整個大陸半數的篩檢量。實證基礎新冠肺炎應對合作組織（Partnership for Evidence-Based Response to Covid-19）指出，實際的肺炎感染狀況可能比帳面數字還要嚴重，並推估確診數約為已知的八倍。
另一個警示則是非洲篩檢結果的陽性比例。美國史丹佛大學（Stanford University）傳染病專家安德魯斯（Jason Andrews）表示，雖然陽性比例不是理想的指標，但鑑於接受檢驗者都有疑似武漢肺炎的症狀，若陽性比例超過5至10%，那就代表還有更多未確診的病例。目前非洲至少有22國篩檢結果的陽性比例超過10%，如阿爾及利亞的91%、蘇丹87%和坦尚尼亞的78%。
坦尚尼亞總統馬古富利（John Magufuli）不信任篩檢結果，妄稱該國檢驗中心混雜木瓜和山羊等樣本進行篩檢，才會出現如此嚇人的陽性比例，而4月29日以來，坦尚尼亞官方停止更新確診數字。不過根據非政府組織和運動者，坦尚尼亞最大城沙蘭港（Dar es Salaam）進行許多武漢肺炎死者的喪禮，5月12日美國大使館也指出當地醫院人滿為患。
