儘管與周邊國家比較，新冠肺炎疫情在台灣控制相對得宜，但隨著感染源調查未明個案出現，家庭感染有衍生社區感染之虞，大型活動是否全面停辦等，中央防疫指揮中心何時提升為「一級開設」，成為各界關切焦點。
根據應變計畫，出現確診病例就可一級開設
前衛生署長葉金川却一言中的：「陣前換將是大忌」，如果一級開設是由行政院長蘇貞昌主持，他寧可選擇陳時中；前衛生署長楊志良則直言，一級開設遲早的事，但這是「政治問題」，理當由行政院長指派指揮官，「但陳其邁（行政院副院長）似乎與地方首長有些摩擦」，楊志良直接建議由副總統當選人，同樣具有醫界背背景的賴清德出任一級指揮官。
兩位前署長意見不盡相同，但不論直接或含蓄，他們都表達了雅不欲蘇貞昌出任一級指揮官的意思，看在最新民調聲望還比蔡英文總統高一個百分點的蘇貞昌眼內，肯定點滴在心，不過，蘇貞昌不要太難過，葉、楊之見代表「防疫靠專業不要靠政治」的民情民意。
根據「因應嚴重特殊傳染性肺炎疫情整備應變計畫」，防疫指揮體系視疫情分四級開設，中國大陸武漢地區出現疫情成立應變小組，這是第四級；武漢疫情有明顯社區傳播並擴大情形，由衛福部疾管署長出任指揮官，這是第三級；武漢地區疫情擴散到其他地區，由衛福部長陳時中出任指揮官，這是第二級；「我國出現確診病例」，則「由行政院長指派指揮官」，台灣在元月下旬成立應變小組之後，三天之內連升三級，從四級直升到二級開設，就是因為出現第一個境外移入的確診病例。
照應變計畫，早在一個月前就可以一級開設，蘇貞昌不自兼，指派也有醫界背景的副院長陳其邁為指揮官，跨部會統合防疫決策，可謂順理成章，蘇貞昌沒吭氣，陳其邁彷彿消音，隔了一個月，終於有人提到陳其邁，說得却是他與地方首長「有些摩擦」？大選早就結束，陳其邁還能有什麼摩擦？說穿了，不過是高雄市長罷免行動未因防疫降溫，還頗有箭在弦上之勢，志在高雄市長的陳其邁兼指揮官有利有弊，兼得好聲望大振，但難保黨內有意競爭之士不平；兼不好豈不提前斷送他補選市長之路？楊志良看得透徹，防疫指揮中心一級開設，確實是「政治問題」，而且是民進黨內的政治問題。
楊志良推薦賴清德出任一級指揮官是異想天開
但楊志良推薦賴清德出任指揮官，就純屬異想天開。
第一，賴清德與蘇貞昌是後輩與前輩，於院長職位却是前後任，不要蘇貞昌却要賴清德，是要氣死誰？
第二，賴清德固有醫界背景，當選副總統，但終究未就任，一屆布衣有醫界背景者的「大老」，在賴清德前面排隊都數不完。
