受白崇禧的影響，蔣介石對二二八事件性質的判斷3月上旬和下旬之間發生了重大變化。事件初期，蔣介石並不認為共黨作亂是主因。在3月7日日記中，蔣認為「此時共匪組織尚未深入，或易為力。」[27]3月10日，蔣公開講述「臺灣事件之經過及處理方針」時，雖然提到自南洋回臺人員有一部份「共產黨員」，但對整個事件，他還是定性為「不幸事件」。[28]3月13日，蔣介石還電令陳儀「請兄負責嚴禁軍政人員施行報復，否則以抗令論罪。」[29]但是，白崇禧告訴蔣「臺灣事變真相與在京所聞者頗有出入。」[30]在讀了白的連番報告之後，蔣越來越把事件看作是臺灣人與共匪聯手叛亂。到了3月31日，蔣在日記中說「臺灣全省各都市為暴徒共匪脅制，叛亂情勢嚴重已極，竟能如計處理，次第平服。」[31]
3月27日晚，根據葛超智的建議，司徒雷登再找蔣介石商談，建議可將臺灣設為特別經濟區，雇用大量美國技術顧問來協助開發臺灣經濟資源。這將需要島民的衷心合作；並且臺灣的出口利潤可被用於償還或保證任何未來的美國貸款。會後，司徒雷登向國務卿馬歇爾匯報說，蔣委員長強調他贊同這項建議，並要求大使著手擬訂具體方案。[32]然而，蔣介石卻在當天日記中寫「彼對臺灣與瓊州之經濟則特重視。甚欲余聘美國人為顧問，並乘此臺灣變亂之時有所染指乎。」[33]可見，蔣心中對司徒雷登的提議抱着懷疑態度。
4月18日，司徒雷登又去找蔣介石，向他提交了一份由葛超智起草的備忘錄，從美國角度概述了二二八事件，並提供了改善局勢的建議。備忘錄提出「為了鼓勵和確保全心全意的努力，必須允許臺灣-中國人在各級政府中佔有更大的份額。人員和行政結構的改革必須徹底；我們認為，半吊子措施和姑息只會導致將來更大的對省政府腐敗、低效和專制的抗議。臺灣可以通過迅速和根本的改革恢復到以前高水平的政治效忠和經濟生產。」[34]蔣介石表示他將親自閱讀中文文本。在美國壓力下，蔣於4月22日任命前駐美大使魏道明出任臺灣省主席，並根據備忘錄建議，著手各項改革。二二八事件後，中華民國政府在臺灣的初步改革，既是為了安撫當地民眾，也是為了回應美國的干涉。
7月11日，美國政府宣佈派二戰時曾任蔣介石參謀長的魏德邁將軍為杜魯門總統特別代表來中國考察。考察期間，他於8月11日至19日來了臺灣一週。8月19日，蔣介石與魏德邁談話6小時，就中國局勢廣泛交換意見。當時，蔣介石研判美國動機「志在先倒我而後達其統治中國之目的。」[35]會後，蔣托司徒雷登轉告魏德邁，他決不能接受美國「監督一切干涉內政之條件，甚望美國能以友邦平等相待。」[36]但是，在回美後給杜魯門和馬歇爾的秘密報告中，魏德邁認為臺灣人「樂見美國託管」，無視蔣的不滿及疑慮。
