這些A型流行性感冒病毒會隨時因基因突變而衍生出新品種流感病毒。從基因學的觀點而言，大的抗原性移轉（浮動／antigenic shift）乃因病毒的RNA重組而來，而小的抗原性漂移（antigenic drift）乃由病毒的RNA突變所致。抗原性移轉是屬於比較大的抗原變異，例如由H1N1到H2N2，這只發生在A型流行性感冒病毒，可以讓病毒變成整個人群都沒有抵抗力的新亞型，因為缺乏抵抗力所以容易造成全世界的大流行，科學家推測這種抗原的移轉據研究很可能是來自於人類與動物之間的流行性感冒病毒的再調和（reassortment），因此，在擁擠與人畜雜居的環境特別容易引起這樣的移轉，例如前述在香港發生的禽流感。
H1N1病毒株首度於1933年被分離出來，但是在1957年消失，由H2N2病毒株取代。20年後，這種病毒再度出現於中國北方，然後散播致世界各地。經過分析後證實，這種病毒基因和1950年代的病毒基因完全相同。沒有人知道這種病毒在這20年間躲到那裡去了。也就是說，造成許多歷史悲劇的流行性感冒病毒並未真正消失，它們還躲在暗處，隨時準備伺機而起。（註十九）
A型（甲型）流行感冒病毒除了引發肺炎外，有時會侵犯中樞神經系統，造成腦病變（encephalopathy）或腦炎等併發症，進而加重病症，慢性病患者也可能因為流感較容易出現併發症，最後因此死亡。即使原本健康狀況不錯的人，病情也可能急轉直下，甚至還有因為罹患流感而導致雙眼永久失明的案例。
流感疫苗注射禁忌與研發
由於流感疫苗在製作的過程當中，都是利用雞蛋來培養病毒，之後再萃取製成疫苗，因此對雞蛋過敏者不宜接種流感疫苗；此外，6個月以下嬰兒，或患有急性惡化疾病、發燒者，不宜接種流感疫苗。基本上，流感疫苗是相當安全的疫苗，個體在接種3、4周後，體內才會出現特定的抗體，其免疫效果僅持續4〜6個月，依據臨床經驗，流感疫苗的保護率在70％〜85％之間。
但為避免有極少數人會出現嚴重副作用，比如噁心、嗜睡、頭痛、肌肉痛及畏寒等，甚至出現過敏性休克等不適情況（臨床表現包括呼吸困難、聲音沙啞、氣喘、眼睛或嘴唇腫脹、頭昏、心跳加速等，但極少發生），建議施打疫苗後先在施打處休息一下，觀察約30分鐘再離開，真有意外發生就可以立即就醫。
治療流行性感冒藥物（例如Ostelmivir／克流感與Zanamivir／瑞樂沙）的研發，即針對神經胺酸酶（NA）而製造，藥物會設法困住神經胺酸酶，使神經胺酸酶無法發生作用，病毒就不會從細胞表面釋放而感染其餘細胞。不過任何藥物都有不同程度和症狀的副作用，流感藥物最常出現比如：噁心、嘔吐、下痢、腹痛和頭痛等症狀。也曾有來自國外的醫學報告，部分患者在使用克流感（Ostelmivir）後，會產生自殘、妄想情形，主要發生於兒科病人，其原因不明，因此服用克流感期間，醫護人員與家中成員應小心監測患者的不尋常行為。
