蔣中正與陳納德固然是指揮不動B-29，可B-29終究還是進駐到了成都這個前進基地。而做為一款遠程戰略轟炸機，B-29的吃油量是令人難以想像的龐大。雖然參謀首長聯席會信誓旦旦的表示B-29不會動到國民政府的物資，還派出C-109與由B-24改裝的C-87等運輸機飛越駝峰輸送物資，甚至還連一些B-29都充當臨時的運輸機，但是物資不足的問題終究無法解決。
很快第20轟炸機司令部就發現，他們從成都起飛每轟炸日本本土一次，就需要來回在駝峰航線上飛行七次，每次任務11小時來搞定需要的燃料與彈藥。在轟炸日本本土為第一優先的戰略考量下，原本要供應給第14航空軍與國民政府的駝峰物資，就難免為第20轟炸機司令部挪用去。B-29幫不上忙就算了，還將中國有限的駝峰物資吸走，那可真是讓陳納德與蔣委員長氣到直跳腳。
從1944年4月開始，國軍正面臨日軍動員52萬兵力發起的「一號作戰」攻勢，急需美軍提供空中支援。B-29奉命不能介入中國戰場的軍事行動，同時還逼迫陳納德必須將第312戰鬥機聯隊的200架P-47與P-51部署到成都，保護B-29的安全。僅有500架飛機的第14航空軍，還要抽出150架飛機支援史迪威在滇緬戰場的反攻，只能拿出最後的150架飛機來抵擋「一號作戰」。
到了1944年秋天，不只是陳納德與蔣中正希望B-29離開中國，就連指揮第20轟炸機司令部的李梅（Curtis E. Lemay）也認為成都不是轟炸日本的理想基地。成都究竟還是離日本本土太遠，B-29想要來回往返兩地的話，攻擊範圍就只能涵蓋到日本九州。對於日本中心地帶的本州，第20轟炸機司令部幾乎是無能為力。
幸運的是，1944年7月傳來了美軍收復塞班島，並於關島、天寧島登陸的好消息。這三座位於馬里亞納群島的島嶼，距離東京只需要1,500英里的飛行航程，在B-29的攻擊範圍之內。此刻另外一支名為第21轟炸機司令部的飛行單位已經組成，待美軍完成關島與天寧島的攻勢之後就要進駐馬里亞納群島，並與中印緬戰區來的第20轟炸機司令部合組為第20航空軍。
開啟通往延安之路
所以到了1944年7月，B-29離開中國幾乎已經成了時間上的問題。在B-29不願意支援國軍抵禦「一號作戰」的情況下，這項決策並不會真正激怒到蔣委員長。真正讓蔣中正難以忍受的，是B-29給了讓美國與中國共產黨建立聯繫關係的絕佳理由。看在蔣中正眼中，日本不過是「疥癬之疾」，中國共產黨才是他真正優先消滅的「心腹大患」。
