林環牆並強調，他的調查是獨立進行，不受台灣任何政黨影響或指使，也不是任何媒體的委託代理，更遑論與所謂中國紅色集團有任何牽連。他堅信學術誠實與政治誠信，是現代文明社會普遍堅持的價值與信念。期許這次調查是「照進裂縫裡面的陽光」，讓陰暗不再能永遠地遮住真相。
3. 調查認為蔡總統的學位論文有何問題？
林環牆認為這本「傳說中的」學位論文，無論紙本、數位電子檔，或圖書收藏資料，35年來（1984年迄今）都不存在。經他引用英國《資訊自由法》（The Freedom Information Act）要求，LSE資訊與紀錄處（Information and Records）以電子郵件告知，蔡總統直到今年6月28日才將這份「傳說中的論文」提繳給LSE圖書館；約兩個星期的7月13日，這本論文也才進入LSE圖書館的數位檢索系統。
今年8月5日，林環牆飛抵倫敦，檢視與閱讀蔡總統送到LSE圖書館的論文，發現它應是由另一本論文影印下每一頁，經電子傳真送到LSE，然後在當地新裝訂成冊，每一頁的邊緣或角落有非常明顯的黑色陰影。此外，論文封面與背面是黑色硬紙板，與當年藍色硬紙板論文的顏色不同。
林環牆還發現，論文「致謝」（Acknowledge）那一頁很可能是重新打字。因為論文每一頁的邊緣或角落有非常明顯的黑色陰影，但只有最前面兩頁完全看不到黑影；第一頁是論文的題目（Title），第二頁就是致謝。
他並舉出幾點博士學位論文不應存在的疏漏：論文有不少英文打印錯誤，雖然書寫更正，但沒有重新打字；論文的附註都以星號（*）加上阿拉伯數字表示，而且附註打字時都未上提，是很簡陋、不專業的處理方式；論文有些章節段落名稱與目錄並不一致，最離譜的是，第一章竟連續遺漏6頁，第5至10頁都不見蹤影。
因此林環牆研判，這本論文應該只是「口試用初稿」，不是為完成博士學位而送交校方圖書館典藏的最後定稿論文。蔡總統當年在LSE的身分頂多是「已完成論文，但未通過論文口試」的博士侯選人。
4. 蔡總統博士論文有無圖書館收藏紀錄？
林環牆指出，蔡總統論文不僅紙本「遺失」，連倫敦大學所有圖書館的電子檢索系統都查不到。至於大英圖書館（The British Library）的電子論文檢索系統EthOS雖然可以查到，但林環牆聲稱他調查發現，這是LSE內部有人於2015年6月間向大英圖書館提報這筆論文資料，當時中國國民黨陣營開始要查蔡總統的博士論文；換言之，LSE內部有人在違法掩護蔡總統。
