值得注意的是華航總稽核方若琳針對此案的發言：
這是從正常的免稅品銷售系統，拉出一條線，然後給出特別的Code（代碼）？讓這個Code（代碼）分別給媒體朋友的、還有給國安體系公部門的，在公部門方面他開放了訂菸這件事，當他開放了訂菸之後，沒有管制這個量（註2）。
依據海關最新公告入境國人合法攜帶菸酒入境，菸類是捲菸200支（等同一條香菸），酒類是1公升。或許有媒體朋友於機上超額購菸入境？然而現在只查「特定」方向的私菸？更不查有無私酒？既然侍衛室（總統警衛室）與華航早有約訂俗成的一套作法，加以菸類依照《菸害防制法》第5條規範，菸品是不能上網公開販售的，因此特勤人員訂購菸品，顯非循此管道，這所謂特別拉出的一條線，給予了特別代碼，又是為誰開的方便之門？這次專機上的成員，除方若琳所說媒體朋友，在團員與隨員部分，是否都有華航免稅商品購物代碼？對於免稅商品，有無購買超額狀況？所謂媒體朋友購買的情形又是如何？若不能全面清查？又怎能撫平國安傷口？
再從李前總統前此訪問美國的團員名單，呂前副總統所言國安會秘書長與總統府秘書長，從來不隨總統出國訪問事，誠是見仁見智，難有定論。
至於媒體報導此案調查局局長呂文忠謀略指導〈防打草驚蛇調查局截流式攔車〉在不影響總統車隊行進，以「截流式」方法攔檢載運私菸車輛的「英勇行徑」？當您了解總統車隊與行政車隊因為任務不同，歷年來都是分別異時各自到離桃機，況且總統車隊前、後，均有警車開道與斷後。想在殿後警車前，攔截總統車隊中的任一車輛，無疑更是天方夜譚。至於文中雖說行動前未曾報告總統，但日後會不會演變成總統事前即已知曉，為除「陋習」，隱忍不發，終而成就總統英明？可能尚在未定之天。
最後國安局退休人員組成的磐安聯誼會，內中成員諸如張悅雄為文「替國安局講句公道話」、郭克勇「呼籲正名別再誤用國安局走私」，這兩位應是護局心切，為文內容卻背離事實真相。
依據國安局在民國100年修定的國安局組織法，從原來立法當初的23條條文，經三次修正後為10條條文，除第1條立法目的，最後一條生效時間，其餘八條的條文，其中竟有四條文明述特種勤務範疇與特勤工作，現今國安局對特種勤務之策畫與執行，更為當前的兩大職掌之一。復依據《特種勤務條例》第二條明定：「本條例之主管機關為國家安全局」。第三條第二款對特勤人員的定義：
特勤人員：指國家安全局特種勤務指揮中心(以下簡稱特勤中心)、總統府侍衛室、內政部警政署保安警察大隊第一警官大隊及國防部憲兵指揮部警衛大隊等，特種勤務專責單位所屬，負責策畫及執行特種勤務相關工作人員。
