賴清德出訪日本前，對納入手機民調丟出反對意見，他認為立委已完成初選，且採取互比式市話民調，如果總統改採納手機，對參與立委初選者不公平；其次，如果要改變遊戲規則難以向社會大眾交代。另外，他也質疑手機民調的公平性。
手機沒區碼，區域立委民調貴
按照民進黨黨內遊戲規則，立委初選是互比與對比式並用，但此階段民進黨立委初選都是現任者，對手人選尚未產生，故大多採取互比式民調；但也有對比式並用，例如屏東二選區，對手是由共識產生。
但因為立委選區全國分割為幾十個，如果也進行手機民調，由於手機並不像市話有區碼之分，樣本取得會比較困難，因此成本要比總統手機民調的費用多七十三倍（共有七十三個區域立委選區），也會很花時間，而總統選區是全國性，故採手機民調會比立委成本低很多。
至於所謂的改變遊戲規則部分，由於當初黨中央顯然是在倉促之下公告民進黨總統初選辦法，或許沒有預測會有挑戰者，故遊戲規則是根據二○一一年所修訂的版本。
但當年民進黨是在野，如今已執政，如果按遊戲規則，民進黨總統初選「僅」能採取對比式，所以要國民黨人選產生才能初選，不然就要雙方共識對手是誰；且當年未考慮第三勢力的部分，要不要納入柯文哲也需要雙方取得共識。
民意調查的方式很多，通常是指市話調查，但市話調查只是其中一種，民意調查也可以是街頭問卷調查、郵寄問卷、網路調查或投票、手機調查、電話call in等等，其中關鍵是「取樣的母體」與「全體母體」的關係，即樣本母體如何抽樣，牽涉民調正確性。
過去市內電話普及，區域號碼字頭分類，甚至鄉鎮市區的電話字頭分類，更能依照統計上分層隨機抽樣，加上事後的加權，讓樣本母體更貼近全體母體。但隨科技進入４Ｇ時代，網路免費通訊軟體取代付費手機與市內電話，手機族快速成長至三、四成，成為市話民調無法接觸的樣本。
可抽樣市話從七百萬降到四百萬
但採取電話民調的初選比較像「隨機被動電話投票」，民進黨為了防弊，民調抽樣是以初選日期前一年發行的「住宅電話簿」為抽樣母體，其實就是早期中華電信會分送至住戶、願意公開自己住家電話的電話簿。但自《個人資料保護法》通過之後，中華電信不再主動配送，願意公開自己住家電話的用戶也急速萎縮。
所以能在民進黨黨初選民調被抽中的前提是，要裝有市話，且願意公開登錄在中華電信公開的電話簿上。台灣全國戶數七百萬，如果按台北市研考會兩年前的委託調查案推估，市內電話不足五百萬戶，加上願意公開的（其實是老用戶沒有去申請不公開），應該低於四百萬戶。
市話抽樣是以戶為對象，以縣市、鄉鎮市區為分層抽樣，但手機是以人為抽樣的對象，以國家通訊傳播委員會（ＮＣＣ）公布的行動通信網路業務用戶號碼核配現況，先將已核配的編碼字首（前五碼）依照隨機抽樣原則抽出局碼，然後以後五碼亂數方式產生，兩者合併為手機樣本號碼，易付卡或移工申請的號碼可以在抽樣前排除。
由於騙案橫行，申購手機門號需要雙證件，故申請門檻較高，目前全國大約兩千八百萬個手機門號。市話是按戶抽樣，手機是按門號抽樣，事後加權都是必要動作。
市話調查會遇到一個問題，就是六十歲以上的樣本偏高，四十歲以下偏低，只能靠加權處理，已經是業界不可迴避問題。
如果年輕族群支持度低的候選人更應該採用手機民調，可以降低因接觸樣本少而加權放大的效果。畢竟手機民調，年輕族群表態率高，看似互補，但兩者資料要合併加權是另一個要面臨的問題。但初選民調是一種被動電話投票，可以採用全手機調查或一半手機一半市話模式。
手機調查「人為」舞弊成本高
過去政黨初選經驗，為了防止舞弊，可以設定條件限縮被調查的樣本母體。以台南市立委初選顏純左為例，同樣委託山水民調公司調查，但結果落差甚大，其差異就是樣本母體的差別。何況手機調查「人為」舞弊的成本比市話高，更能防弊。
賴清德說，民主就是人民做主，既然政黨辦初選，愈多人民參與愈好，就現況來說，是要選擇只有不到四百萬的市內電話當樣本母體，還是兩千八百萬手機門號母體做為全體抽樣，道理淺顯易懂，除非反對的理由背後有其他動機，那就另當別論了。
