若議會不同意柯文哲這樣使用二備金，有什麼制衡機制？吳碧珠表示，過去在陳水扁任市長時期，議會不同意扁用二備金辦理入聯公投，因此不認這筆帳，也不同意核銷，如今該筆帳目仍在行政院審計處的年度轉核中，成為一年拖過一年的帳。簡言之，議會雖對已經核給柯文哲的錢沒輒，但可在事後不認帳，使其成為一筆累積下去而無法登錄的帳。
對於柯文哲於上一年度到議會爭取高額二備金時，說給多一點錢可以讓市政更有效率的說法，吳碧珠回擊「效率也要顧及法律」！言下之意，就算認為法規不夠妥善，也應修法後才能動錢，不能聲稱自己「有信用」或「有效率」作為動用錢的依據。
綠營質疑：可預見的支出「為什麼藏起來？」
不僅藍營對柯文哲動用二備金的狀況有意見，就連民進黨也不認同。市議會民進黨團秘書長張茂楠表示，二備金必須是「因應緊急」動支，但初步看來，柯市府的二備金使用有「迴避正常公務預算的情形」，「顯然有浮濫，不夠嚴謹」。
張茂楠舉例柯市府已經使用的項目，像是花980萬做宿舍活化並不符合緊急需求，且應是去年編列預算時可以預見的支出項目，應循正規途徑編列，局處卻不編在年度預算中，反而去跟柯文哲討二備金，「為什麼藏起來，不光明磊落？」此外，有關世大運經費也動用二備金2700萬，張茂楠認為，這也是可以預見的支出，沒有理由「躲」在二備金中。
由於各局處編列預算者，都是熟悉預算且年年編列的公務員，竟出現不在公務預算中編列，卻要用柯文哲的二備金，究竟是什麼樣的心態導致如此做法？張茂楠分析，應是因為每年的預算總額有限，送出局處的初步概算會有浮編的情況，加總會超過年度可接受的總支出，因此，局處會採取「預謀性的預算策略」，先自砍預算，再紛紛向柯文哲要錢。
反制濫用二備金 議會可以這樣做
對於有千萬費用是以二備金作做先期規劃費，形同要議會埋單往後所有的「執行費」，吳碧珠嚴正表示，「柯文哲不能移用二備金來偷渡下一個年度的預算」。至於議會對已花的錢怎麼制衡？吳碧珠表示，議會可以要求監察院審計部嚴格審理，不過她也不諱言，中央小英政府與柯是盟友，恐會放行；此外，吳碧珠也說，議會可以在下一年度給予二備金時，立下動支前提條件的「但書」，為下一年度柯文哲動用二備金設下更高門檻，以此反制柯文哲濫用議會對其信賴而衍生的擴權情形。
吳碧珠表示，柯文哲的作法已嚴重「破壞預算制度」，違反先計畫、次編預算、後執行的「預算秩序」，讓本就不佳的府會關係，再度雪上加霜。
柯文哲選擇如此使用二備金的後續影響，恐包括盟友民進黨議員也不會再為預算保駕護航，加上日前柯市府的原民會主委陳秀惠嚴重得罪議會，幾位議員已私下表示，將對市府下一年度預算「從嚴審理」，「逐筆刪減」與「打折」的情況也會越來越嚴重，屆時，不但第一線承辦公務員會很難做事，就連柯文哲要落實的「柯P新政」，都會因為沒有經費而頓失所依。
