醫藥及生物科技產業，已經開始利用醣分子研究成果，做疾病治療及預防。可能運用包括生質酒精（Bioethanol）、流行性感冒病毒治療、紅血球生成素（Erythropoietin）、癌症免疫治療、癌症疫苗、流行性感冒疫苗…等等。
研究醣科學的難度
單單理解染色體、DNA、基因、蛋白質…的機制，還是過於籠統。醣與蛋白質、醣與脂連接的狀況及方式，決定最終生理功能。
基因由4種配對鹼基串連而成，排列最單純。蛋白質由20種胺基酸構成，胺基酸的合成也比較單純，胺基酸只有頭、尾兩個連接點，無論多少個胺基酸相連，都一定呈一條線；因此胺基酸和核苷酸的排列變化都比較少。如果以6碳醣葡萄糖和果糖為例，在六個碳原子中，各有五個可以連接其他單醣，而且每一個連接點都有上、下兩種連接方式。如果各選4種，DNA有256種排列，蛋白質有16萬種組合方式，四個單醣組成四醣體約有1500萬種組合方式。寡糖普遍由3-9個單糖分子聚合而成，多醣聚合的單醣更多，單醣通常有3-7個碳原子，不要說真去合成，就是光把可能組合列出來，都是天文數字。醣類分子分析的難度，要超越基因、蛋白質很多。
醣科學迄今仍然存在一些尚未解決的難題，包括沒有普遍性的鑑定方法分析醣類分子的組成及鍵結；沒有自動化裝置，對任何醣類分子的合成。
翁院長團隊的貢獻
早期翁院長團隊多只限於醣類天然物的純化與鑑定，以及醣類合成方法的開發；後來還加入結構生物學、酵素學和分子生物學等的研究。
人體內有九種重要的單醣，任一種單醣若加上不同的保護基，反應活性也會改變，翁院長團隊為每一種單醣都設計了20~30種安裝保護基的方式，量測醣鍵結反應主要醣授與者（Glycosyl donor）的反應活性，並建立資料庫。譬如某種寡醣（Oligosaccharide）的合成，需要形成四個醣苷鍵，可以事先分析參與合成的醣授與者的活性值，依序加入醣類分子中間體及反應試劑。這種方法的最大好處是整個醣分子的組合，可以在一個反應瓶下進行（稱為一鍋化合成，One-pot Synthesis），不必將每一個反應分別處理、純化，大大減少流程時間，並大幅提高總產率。此自動化涵蓋酵素有機合成、自動化快速醣分子化學合成、及醣蛋白合成。
翁院長團隊為了合成艾滋病抗體醣分子gp120，找到辦法讓一群中性結沒有活性反應的醣鍵結合成目標抗體，這是極為艱鉅的工作，成果發表在2016年3月份自然雜誌（Nature Chemistry 8, 338–346 (2016)），並在2016年以色列愛因斯坦講座中宣讀。
