另外，立法院在審查《財團法人法》過程，為避免企業捐助財團法人，長期把持董事會，所導致的「萬年董事」問題，特別訂定董事會換血規定，要求3年一度的董監事改選，至少要有1/5的董事席次必須更換，這項規定，目前在業界也有反對的聲音。
公益團體負責人表示，「《財團法人法》要求董事會1/5席次必須更動，那剩下的4/5席次維持不變，難道就不是『萬年董事』了嗎？」
該負責人強調，社福機構要找董監事已經很困難，現在《財團法人法》還要求每3年要更換1/5席次董事，還要求董事必須具備「相關領域專長」，這些都將增加公益團體的法遵成本。
更能取信於民 公益團體仍肯定其意義
然而，儘管《財團法人法》提高公益團體的法遵成本，但《財團法人法》的立法仍有其正面積極意義。
該名公益團體負責人表示，《財團法人法》要求財務報表簽證並建立內稽內控機制，將可以提高財團法人財務透明度，讓透明度較高的財團法人，更能取信於人民，財務強制揭露的結果，也將使少數借「財團法人」外殼進行利益輸送的機構「現形」，「有些『休眠』的法人，過去幾十年來拒絕繳交財務資料，對於這些『要死不活』的法人，主管機關終於可以祭出公權力，撤銷法人登記。」
另外，本次《財團法人法》立法，也開啟了財團法人整併與跨界的空間，公益團體負責人表示，目前很多企業為推動跨領域公益事業，被迫成立教育、文化、慈善等不同類型基金會，在《財團法人法》修法後，公益財團法人若因階段任務已達成，希望跨到其他領域，可以不必再另外成立基金會，只需要改隸主管機關即可，財團法人也可以透過整併擴大規模。
