台南市政府以鐵路地下化工程為由提出多項都市計畫，5月14日在台南市初審通過，21日送內政部都委會審查。由於都市計畫涉及強制剝奪人民財產，其土地徵收必要性就要很強，而包括路線、工法、土地取得方式、經費及進度等等，都與土地徵收直接相關，因此都委會必審的重點之一，就是土地徵收必要性。
很遺憾，這些在台南市都委會審查時幾乎沒有實質討論就通過，當天會議甚至做成一項決議，「此案已經行政院核定，因此包括路線規劃及工法，非屬都委會審查範疇」。都委會做決議把自己依都市計畫法所賦予的審查職權全部抹去，還推給行政院已核定，如果行政院核定的案子都委會不能審，那還要都委會幹嘛？
地方都委會不盡責，擁有最終審查權的中央都委會就要扛起來。21日內政部都委會只有2名委員出席，土地徵收範圍內的地主陳情後，受限於時間未進入實質討論，下一次審查務必針對以下幾點爭議，做公開且實質的審查。
一、路線不必東移也能完成鐵路地下化工程，為何非東移不可？
台南市政府提到這些都市計畫是「配合」交通部鐵路地下化工程才研擬，但其實這兩者不必然有絕對相關。因為此案在一九九六年就有一個通過環評審查的版本，並不是現在的路線東移版，而是直接在現有鐵軌地面下做地下鐵軌，那個規劃所要徵收的土地很少，但路線改成東移版，需徵收的土地擴大到三百多戶。
也就是說，已經有一個版本證實，鐵路地下化工程不必東移、不必徵收這麼大片面積土地，就可以完工。既然如此，為什麼路線非要東移、犧牲這麼多人不可？
台南市咬住這個方案是行政院在二○○九年核定，但都已經過六年了，其間不論社經或工程技術都改變很大，方案可能早已不合時宜。更何況修改方案並請行政院重新核定是一件很平常的事。抱著「行政院已核定」這句話不放，反而非常奇怪。
二、鐵路地下化後的地上土地，為什麼要做公園、而不是交換給人民？
所以，這很清楚是台南市政府自己要的都市計畫，並非只是「配合」交通部而已，當然這也沒什麼不對，因為台南市本來就有擬定都市計畫的權利。為免被質疑鐵路地下化後，地面土地將被炒作圖利建商，台南市長賴清德表示，包括鐵路地下化完工後、以及舊鐵軌拆除後的地面全部做道路，他保證沒有人有機會利用徵收土地謀利。這點大家不必急著猜測，因為不久的將來就可驗證(如果有機會的話)。
只不過這並不是重點，依都市計畫法第50條之2規定：「私有公共設施保留地得申請與公有非公用土地辦理交換」。還有，依土地徵收條例第3-1條規定：「需用土地人興辦公益事業….，應優先使用無使用計畫之公有土地或國營事業土地」。
