目前南海局勢緊張，越南接連發生大規模排華運動，台商飽受波及。《新華社》14日中午以快訊報導，國台辦發言人馬曉光應詢時表示，大陸方面已通過多種管道，提出兩岸在南海問題上協同合作的倡議，希望得到台灣有關方面的回應。在此敏感時刻，對岸的喊話尤令外界關注。
馬曉光提出的合作倡議，具體內容尚且不知。早在2012年10月，兩岸學術研究機構共同發表2011年南海地區形勢評估報告，內容建議應建立兩岸軍事協調機制，共同維護南海主權，並把南海合作事宜首先納入兩岸兩會（海基會與海協會）協商機制當中。媒體詢問國台辦發言人楊毅是否贊同此觀點？
楊毅2012年10月31日在例行記者會上說，中國對南海諸島及其附近海域擁有無可爭辯的主權，維護國家主權和領土完整，「維護中華民族的整體利益是兩岸同胞的共同責任。我們歡迎兩岸各界人士就兩岸南海合作事宜提出積極建議，也樂見兩岸有關企業和民間機構就此問題展開探討。」
事後，記者請教海軍人士，在南海維權問題上兩岸一旦合作，在技術操作上有哪些困難？他說，兩岸仍處於敵對狀態，雙方海軍既無通聯前例，作業程式也不同，「根本談不上操作！」這是政治層面問題，兩岸敵對狀態不解除，海軍只能以敵對的作業程式因應海情。
2013年5月9日菲律賓公務船射殺台灣漁民引發「廣大興號事件」。《新華社》記者5月15日詢問國台辦發言人楊毅，大陸方面對此事件是否做出進一步評論？楊毅說，中方多次強烈譴責菲方槍殺無辜台灣漁民的野蠻行徑。「我們要求菲方認真嚴肅對待，儘快徹查真相，嚴懲兇手，給被害漁民一個交代。」
台灣媒體接著提問，台灣將以軍事演習向菲律賓示威，大陸方面是否支持台方行動？楊毅表示，「維護兩岸漁民權益是兩岸雙方責任所在。我們已多次強調，要求菲方徹查真相，嚴懲兇手，給受害漁民一個滿意的交代。」
大陸媒體又問，中國海軍近日在南海實施常態化巡邏制度，同時東海艦隊完成西太平洋演訓任務後刻意經過巴士海峽，外媒認為這是大陸對台灣的支援，國台辦有何評論？楊毅指出，「維護台灣同胞的安全和權益是我們一貫的做法。至於你提到那些軍艦的活動，我建議你向國防部詢問。」
2013年5月18日《環球時報》發表社論稱，大陸與港澳兩地應協助台灣共同制裁菲律賓，如限制從菲律賓進口商品，或鼓勵民眾不要前往菲律賓旅遊等，媒體詢問國台辦做何評論？楊毅說，「我們會密切關注事態的後續發展。我們要求菲律賓採取切實措施，杜絕類似事件再次發生。」
以上是國台辦近2年來對兩岸在南海問題上的表態。雙方有多少默契，做出多少實質上的合作，有賴歷史印證。在東海問題上，同樣能看出類似的軌跡。
