前總統馬英九於1999年擔任台北市長時領養流浪犬馬小九，同年馬小九因病住院，期間所花費金額共新台幣7萬9700元，全都由馬英九的首長特支費所支付，因此遭告發公款私用，然而因先前馬英九特別費案已無罪定讞，台北地檢署今（20）日偵查終結，對馬英九做出不起訴處分。
馬英九1999年擔任台北市長期間，於市府廣場前領養馬小九，同年8月25日馬小九因呼吸道感染住院，直到9月2日才出院。住院期間所花費高達7萬9700元，全都是用馬英九的首長特支費支出。然而，當時台北市政府核銷帳目上，這筆金額卻特別註明是用於「禮品」，因此遭告發貪汙起訴。
不只如此，1998年12月至2003年12月間，馬英九每個月底都以領據請領下個月市長特別費的半數17萬元，匯進台北市銀行的薪資帳戶內，再轉入妻子周美青的帳戶，遭控涉嫌詐領特別費。
台北地檢署表示，2011年5月立院即通過特別費除罪化法案，因此2006年12月31日前各機關支用特別費，其報支、經辦、核銷、支用及其他相人員的財務責任均視為解除，不追究其行政及民事責任，因此1999年的馬小九案也不再追訴。
另外，馬英九遭控的利用職務詐取財物罪，也因為檢方先前偵辦馬英九特別費案時曾將他起訴，但該案已在2008年4月經最高法院判處無罪，台北地檢署認為此案與前案判決事實相同，20日偵查終結，馬英九無罪定讞。
