駐美大使沈呂巡21日透過我駐美代表處發表聲明證實，接獲新政府通知，將於6月初離任。媒體傳出沈呂巡扣壓駐美國新任大使同意函，才遭火速拔官。沈呂巡25日透過駐美代表處臉書發表「致僑界說明信」，強調絕無扣壓駐美新使同意函一事，更表示自己絕無戀棧之意。
我駐美代表處甫於當地時間20日舉行新任正副總統就職慶祝酒會，隔天沈呂巡就透過代表處發表聲明，證實已獲新政府通知，必須於6月初離任。而沈呂巡於4月中提出的請退案與新任駐美大使高碩泰的人事案，也是蔡英文總統上任至今1周內，唯一核定的駐外代表人事任免。
針對沈呂巡被要求火速離任，有外交人士為其抱不平，另一方面卻傳出係因高層懷疑沈呂巡扣住美國的新大使同意函，導致蔡英文一上任就批准其辭呈。
對於外界質疑，沈呂巡25日以「致僑界說明信」，在臉書上向各界說明。他在信中強調，「本人絕無戀棧之意」，在4月中旬便以電報提出請辭，且為配合繼任者提早到任，故未循政黨輪替後有1至2個半月準備期之前例，原本就規劃在6月中旬離任，並已向高層呈報。
沈呂巡並強調，駐美代表處絕未積壓公文。他還原經過澄清，在4月中旬便奉令向美國徵求新任大使同意函，在當天便擬妥函稿，報外交部請核，卻遲遲未獲回覆，5月初再次催促外交部，亦無結果。
沈呂巡說，所謂美處扣壓美方同意函更屬失實。他特別澄清，駐美代表處並未經手同意函，加上美國在台灣也有代表機構，美處「何能一手遮天」？
沈呂巡說，他一向恪遵法令行事，當初未奉明令免職之前，當然不能自定個人行程，提前展開交接與辭行等事；如今忽然接獲命令，必須在2周內離任，確實甚為迫促，但仍會遵行命令，更不願因此造成誤解議論或任一方之困擾。
